在两家关联公司工作，工龄连续计算的情况下，负责的公司通常是新用人单位，但具体责任承担需结合实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、工龄连续计算的法律依据与条件

根据《劳动合同法实施条例》第十条，劳动者非因本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作的，劳动者在原用人单位的工作年限合并计算为新用人单位的工作年限。这里的“非因本人原因”是关键，通常包括以下几种情形：

1. 用人单位以组织委派或任命形式调动：如母公司委派员工到子公司工作。
2. 用人单位未依法支付经济补偿金即变更用工主体：如原公司未支付经济补偿，便让员工与关联公司签订新合同。
3. 关联企业间轮流订立劳动合同但实际工作内容、地点未变：如员工在关联公司间轮换，但工作性质、地点等未发生实质变化。
4. 其他由用人单位主导的人事安排：如公司更名、分立后重新签合同，且业务实质延续。

二、负责公司的确定

1. 若满足工龄连续计算条件：

   • 新用人单位负责：在工龄连续计算的情况下，新用人单位（即员工当前签订劳动合同的公司）需承担与工龄相关的责任，如支付经济补偿金时，需将原用人单位的工作年限合并计算。
   • 举例说明：若员工在A公司工作3年，后被安排到关联B公司工作5年，且满足工龄连续计算条件，则员工在B公司被裁员时，经济补偿金应按8个月计算（3年+5年）。

2. 若不满足工龄连续计算条件：

   • 各自公司负责：若员工在两家关联公司的工作变动是因其本人原因，或用人单位已依法支付经济补偿金，则工龄不连续计算，各公司仅负责其与员工签订劳动合同期间的责任。

三、关键争议点与解决路径

1. 举证责任分配：

   • 员工需提供初步证据：如调令、工资发放记录、社保缴纳凭证等，以证明其非因本人原因被安排到新用人单位工作。
   • 用人单位需证明调动系员工主动申请或已支付经济补偿：若用人单位无法提供相反证据，则可能承担不利后果。

2. 经济补偿金计算：

   • 工龄连续计算时：经济补偿金的工作年限应累加计算。
   • 计算公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（月工资指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资）。

四、操作建议

1. 对员工：

   • 保存人事调动文件、考勤记录等证据，以备不时之需。
   • 在新合同签订前，书面确认工龄连续性，避免后续纠纷。
   • 发现权益受损时，及时申请劳动仲裁，维护自身合法权益。

2. 对企业：

   • 规范关联企业间人事调动流程，确保符合法律规定。
   • 支付经济补偿金时，明确告知员工工龄处理方案，避免误解。
   • 通过补充协议明确工龄计算规则，减少潜在纠纷。

总结来说，在两家关联公司工作，工龄连续计算的情况下，新用人单位通常需承担与工龄相关的责任。但具体责任承担需结合实际情况判断，包括工作变动的原因、是否支付经济补偿金等。若您在此方面遇到具体问题，欢迎直接向我咨询，我将为您提供专业的法律建议。