您好，关于您提出的工伤认定申请部门以及诊断书复印件的问题，我将为您详细解答。

首先，关于工伤认定在哪个部门申请的问题： 工伤认定应由职工所在用人单位承担首要的申报义务，向当地的社会保险行政部门提出申请。如果用人单位未在规定时间内提出申请，工伤职工或者其近亲属，以及工伤职工所在用人单位的工会组织，也有权在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，向社会保险行政部门提出工伤认定申请。

其次，关于诊断书只有复印件是否可以的问题： 在申请工伤认定时，需要提交的材料包括工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料，以及医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。这里提到的医疗诊断证明或职业病诊断证明书，原则上应当是原件。然而，如果因为某些特殊原因，您只能提供诊断书的复印件，那么建议您在提交复印件的同时，向社会保险行政部门说明情况，并尽可能提供其他相关证据来支持您的工伤认定申请。社会保险行政部门在受理申请后，会根据实际情况进行审核，如果复印件能够清晰反映您的伤情，并且有其他证据相互印证，那么也有可能被接受。但为了确保申请的顺利进行，建议您尽量提供原件或者通过合法途径获取诊断书的原件或加盖公章的复印件。

最后，我还想提醒您，工伤认定有一定的时限要求，社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定。因此，请您务必在规定时间内提交完整、真实的申请材料，以免影响工伤认定的结果和您的合法权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。