如果员工发生交通事故被认定为工伤，而用人单位不服这一认定结果，用人单位可以采取以下措施来维护自身权益：

1. 申请行政复议：

   • 法律依据：根据《工伤保险条例》第五十五条的规定，用人单位如果对工伤认定结论不服，可以自收到认定书之日起60日内，向作出工伤认定的社会保险行政部门的上一级主管部门申请行政复议。
   • 操作建议：用人单位应准备充分的证据材料，如事故现场照片、证人证言、员工考勤记录等，以证明员工所受伤害并非工伤或不符合工伤认定的条件。同时，用人单位应详细阐述不服工伤认定的理由，并提交给复议机关。

2. 提起行政诉讼：

   • 法律依据：如果用人单位对行政复议结果仍然不服，可以在收到复议决定书之日起15日内，向人民法院提起行政诉讼。
   • 操作建议：在提起行政诉讼前，用人单位应仔细研究复议决定书，找出其中的法律漏洞或事实错误。在诉讼过程中，用人单位应积极配合法院的调查和审理工作，提供充分的证据和法律依据来支持自己的主张。

3. 关注工伤认定程序：

   • 程序合法性：用人单位应确保工伤认定程序合法合规。如果认为工伤认定过程中存在程序违法或事实认定错误的情况，用人单位可以在复议或诉讼过程中提出异议。
   • 证据收集：用人单位应积极收集与工伤认定相关的证据材料，如员工的工作记录、事故报告、医疗证明等。这些证据材料将有助于用人单位在复议或诉讼过程中证明自己的主张。

4. 与员工协商：

   • 协商解决：在复议或诉讼过程中，用人单位也可以考虑与员工进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于减少法律纠纷带来的时间和成本消耗，同时维护用人单位与员工之间的良好关系。
   • 协商内容：协商内容可以包括工伤赔偿的金额、支付方式、支付时间等。在协商过程中，用人单位应确保自己的权益得到充分保障，同时也要考虑员工的合理诉求。

在采取上述措施时，用人单位需要注意以下几点：

• 时效性：无论是申请行政复议还是提起行政诉讼，用人单位都需要注意时效性的问题。逾期未提出申请或提起诉讼的，将可能丧失相应的法律救济权利。
• 证据充分性：用人单位在提出异议或主张时，应确保提供的证据材料充分、真实、有效。证据不足或存在瑕疵的，将可能影响复议或诉讼的结果。
• 法律合规性：用人单位在处理工伤认定纠纷时，应确保自己的行为符合法律法规的规定。避免采取违法或不当的手段来维护自身权益，否则将可能面临法律制裁。

如果用人单位在处理工伤认定纠纷过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据具体情况为你提供详细的法律建议和帮助。