结论：开发商在只有一方配合过户的协议，且该方未到场签字、不知情的情况下进行更名，这一行为通常是不合法的。下面我将从多个角度进行详细分析。
一、法律角度分析
合同效力问题：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的成立需要双方当事人的真实意思表示，并且应当符合法律、行政法规的强制性规定。在房屋买卖或过户的情境中，如果只有一方签署了配合过户的协议，而另一方并未到场签字且不知情，那么这份协议对于不知情的一方来说，是缺乏其真实意思表示的，因此可能不具有法律效力。
开发商的义务：
- 开发商在房屋交易过程中，有义务确保交易的合法性和合规性。这包括确保所有相关文件的真实性和完整性，以及确保交易双方都明确知晓并同意交易条款。如果开发商在未经另一方同意的情况下进行更名，这可能构成对开发商义务的违反。
更名行为的合法性：
- 更名行为通常涉及到房屋所有权的转移，这必须基于合法有效的合同或协议。在没有合法有效合同或协议的情况下，开发商擅自进行更名，可能构成对房屋所有权的非法侵犯，甚至可能涉及欺诈等违法行为。
二、实际操作角度分析
过户流程：
- 正规的房屋过户流程通常要求买卖双方共同到场，签署相关文件，并办理过户手续。如果只有一方到场并签署了配合过户的协议，而另一方并未参与，那么这样的过户流程是不完整的，也是不合法的。
风险防控：
- 对于购房者来说，如果开发商在未经其同意的情况下进行更名，这可能导致购房者面临一系列风险，如房屋所有权纠纷、合同无效等。因此，购房者有权要求开发商停止这种非法行为，并寻求法律途径维护自己的合法权益。
三、建议与措施
核实协议真实性：
- 如果购房者发现自己并未签署配合过户的协议，或者对协议内容存在疑问，应立即与开发商进行沟通，核实协议的真实性和合法性。
寻求法律帮助：
- 如果购房者认为开发商的行为侵犯了自己的合法权益，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的权益。这可能包括起诉开发商要求撤销更名行为、赔偿损失等。
保留证据：
- 在整个过程中，购房者应保留好所有相关证据，如购房合同、付款凭证、沟通记录等，以便在需要时提供证明。
综上所述，开发商在只有一方配合过户的协议，且该方未到场签字、不知情的情况下进行更名，这一行为通常是不合法的。购房者应核实协议真实性、寻求法律帮助并保留好相关证据，以维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。