生猪运输车辆未消毒的处罚需根据具体违法情形及适用法律进行判定，主要涉及《中华人民共和国动物防疫法》及地方性法规，处罚措施包括警告、罚款、责令改正，情节严重者可能面临更高额罚款或吊销资质。 以下是具体分析：

1. 行政处罚依据及措施
   根据《中华人民共和国动物防疫法》第九十四条，若运输车辆未按照规定进行清洗消毒，动物卫生监督机构可责令改正，给予警告；拒不改正的，处一千元以上一万元以下罚款。

   • 关键点：处罚分两档，首次违法以警告和责令改正为主；拒不改正或多次违法则升级为罚款。
     
   • 例外情形：若未消毒行为导致动物疫病传播等严重后果，可能触发《动物防疫法》第九十五条，面临一万元以上十万元以下罚款，甚至吊销动物诊疗许可证等更严厉处罚。

2. 地方性法规的补充规定
   部分省份（如《广东省动物防疫条例》）可能细化处罚标准，例如：

   • 对未消毒车辆直接处五千元以上三万元以下罚款；
     
   • 若同时存在未备案、未配备定位设备等违规行为，可能合并处罚。
     
   • 建议：需结合运输车辆所在地的地方性法规进一步确认。

3. 执法实践中的考量因素
   处罚力度通常综合以下情节：

   • 主观过错：是否明知故犯或因疏忽未消毒；
     
   • 危害后果：是否引发动物疫病传播风险；
     
   • 配合程度：是否主动整改或抗拒执法。
     
   • 示例：若运输车辆未消毒但未造成实际危害，且及时整改，可能仅受警告；若导致疫情扩散，则可能面临刑事责任（如妨害动植物防疫罪）。

温馨提示：生猪运输车辆需严格遵守消毒制度，建议运输前通过官方渠道查询目的地防疫要求，并保留消毒记录备查。若您遇到具体处罚争议或需要合规指导，可直接向我咨询，我将结合最新法规和案例为您提供详细方案。