当您起诉一家公司却发现对方已经注销时，不必过于担心，您仍然可以采取一系列措施来维护自己的合法权益。以下是针对不同情况的具体分析和建议：
一、公司注销前依法清算的情况
查看清算报告：
- 首先，您需要获取并查看公司的清算报告，了解公司的资产处置和债务清偿情况。如果清算报告显示公司在注销前已经合理清理了债权债务，并且有剩余财产，那么您可以要求以这部分剩余财产来承担法律责任。
特定情形下的责任追究：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第十九条，如果有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人在公司解散后恶意处置公司财产给债权人造成损失，或者未经依法清算，以虚假的清算报告骗取公司登记机关办理法人注销登记，您作为债权人可以主张他们对公司债务承担相应赔偿责任。
二、公司未经依法清算即办理注销登记的情况
变更被告：
- 在这种情况下，您可以直接将被告变更为已注销公司的股东、发起人或者出资人。根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条，企业法人未依法清算即被注销的，可以以其股东、发起人或者出资人为当事人提起诉讼，要求他们对公司债务承担清偿责任。
证明股东过错：
- 您需要收集证据证明股东、董事或实际控制人存在过错行为，如恶意处置财产或提交虚假清算报告等。这些证据将有助于您在诉讼中主张相关责任人的赔偿责任。
三、公司注销后发现遗漏债务的情况
申请重新清算：
- 如果公司注销后才发现有遗漏的债务，您可以申请重新对公司进行清算以清偿这些债务。这通常需要通过法律程序向法院提出申请，并由法院指定清算组进行清算。
要求相关主体承担责任：
- 如果无法重新清算或相关主体存在过错导致无法清算，您可以要求这些主体承担相应的赔偿责任。这同样需要您收集充分的证据来证明相关主体的过错行为。
四、其他建议措施
向市场监管部门提出异议：
- 在诉讼期间，如果发现公司正在办理注销手续，您可以向市场监管部门提出异议，请求暂停注销程序以保障您的诉讼权益。这可以防止公司通过注销来逃避法律责任。
申请财产保全：
- 为确保自身利益不受侵害，您可以向法院申请财产保全或其他诉讼保护措施，如冻结银行账户、查封财产等。这些措施可以防止公司在诉讼期间转移或隐匿财产。
五、法律依据汇总
- 《中华人民共和国民法典》第七十条：规定了法人解散后的清算义务和责任承担。
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第十九条和第二十条：明确了公司解散后相关责任人的赔偿责任和清算义务。
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条：规定了企业法人未依法清算即被注销时的诉讼当事人确定原则。
在处理此类情况时，我建议您积极收集证据、与法院保持沟通，并根据具体情况选择合适的诉讼策略。如果您在处理过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。