当公司作为原告在起诉后注销了，这种情况确实会给诉讼带来一定的复杂性，但并非无法处理。以下是根据相关法律法规及具体案情，为您提供的详细分析和建议：
一、公司注销后的法律地位
公司注销后，其民事主体资格即告消灭，原则上不再承担民事责任。然而，这并不意味着诉讼就无法继续或原告的权益无法得到保障。关键在于公司注销的程序是否合法，以及是否存在相关责任主体需要承担清偿责任。
二、根据注销程序的不同情况处理
公司未经依法清算即办理注销登记
- 直接追加被告：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条，若公司未依法清算即被注销，您可以以其股东、发起人或者出资人为当事人提起诉讼或申请追加为被告。这些主体可能因公司注销而需要对公司债务承担清偿责任。
- 证明股东过错：若有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人，在公司解散后存在恶意处置财产或提交虚假清算报告骗取注销登记的行为，您需收集证据证明上述过错，以便要求他们承担赔偿责任。
公司依法进行了清算并办理注销登记
- 查看清算报告：若公司依法清算注销，清算报告是关键文件。您应仔细审查清算报告，确认债权债务是否已合理清理和处置。
- 特殊情形处理：若清算组未履行通知和公告义务，导致您未及时申报债权而未获清偿，您可主张清算组成员对损失承担赔偿责任。但需注意诉讼时效问题，及时采取行动。
三、法院处理方式与您的应对措施
法院处理方式：
- 若公司依法注销且有清算主体，法院会通知清算主体参加诉讼并承担责任。
- 若注销违法或有瑕疵，法院可能认定注销无效，诉讼继续进行。
- 若无法确定清算主体或清算主体无法担责，法院会综合考虑后作出裁决，以保障您的权益。
您的应对措施：
- 收集证据：尽快收集并保存与公司注销相关的所有证据，包括清算报告、注销登记文件等。
- 报告法院：及时向法院报告公司注销情况，申请采取相应措施，如追加被告、恢复诉讼等。
- 追加被告：若公司未经依法清算即注销，可申请追加股东、董事等相关责任人为被告。
- 申请强制执行：若公司注销后有剩余财产可供执行，或相关责任主体有财产可供执行，可申请强制执行以弥补损失。
四、法律依据与注意事项
- 法律依据：主要依据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》和《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的相关规定。
- 注意事项：
- 与法院保持沟通，了解案件进展，及时提供所需材料。
- 保留好所有证据材料，以备不时之需。
- 寻求专业律师帮助，制定详细的追债方案，确保您的权益得到最大保障。
综上所述，当公司作为原告在起诉后注销时，您应根据具体情况选择合适的法律途径来维护自己的权益。在实际操作中，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。