结论：中介收房三个月后打款是否合法，不能一概而论，需结合双方签订的合同条款、交易习惯以及相关法律法规来综合判断。

1. 合同条款的约定

在房屋买卖或租赁过程中，中介作为居间方，其与买卖双方或出租方与承租方之间会签订居间合同或相关协议。这些合同中通常会明确约定款项支付的时间、方式等关键条款。

• 若合同中有明确约定：如果合同中明确规定了中介在收房后三个月内打款给卖方或出租方，且这一约定不违反法律法规的强制性规定，那么中介按照合同约定时间打款就是合法的。
• 若合同中无明确约定：如果合同中没有明确约定打款时间，或者约定不明确，那么就需要参考交易习惯和相关法律法规来确定。

2. 交易习惯的影响

在房屋买卖或租赁市场中，存在一定的交易习惯。这些习惯可能因地区、市场环境等因素而有所不同。

• 如果当地或该行业的交易习惯中，中介收房后三个月打款是常见的做法，且这一做法不违反法律法规，那么可以认为这种做法是合法的。但需要注意的是，交易习惯不能凌驾于法律法规之上，如果交易习惯与法律法规相冲突，应以法律法规为准。
• 如果交易习惯中并无明确规定，或者当地市场对此做法存在争议，那么就需要进一步参考相关法律法规。

3. 相关法律法规的考量

在房屋买卖或租赁过程中，涉及的主要法律法规包括《中华人民共和国民法典》中关于合同、居间合同以及房屋买卖、租赁的相关规定。

• 根据《民法典》的相关规定：居间合同是居间人向委托人报告订立合同的机会或者提供订立合同的媒介服务，委托人支付报酬的合同。居间人应当就有关订立合同的事项向委托人如实报告。如果中介在居间过程中存在故意隐瞒重要事实或者提供虚假情况等行为，损害委托人利益的，不得要求支付报酬并应当承担损害赔偿责任。但这并不直接涉及打款时间的问题。
• 关于打款时间：如果合同中没有明确约定，且交易习惯中也没有明确规定，那么中介应当在合理的时间内将款项支付给卖方或出租方。这里的“合理时间”需要根据具体情况来判断，包括但不限于房屋交付情况、款项金额大小、双方协商情况等。如果中介无正当理由拖延打款，可能构成违约行为，需要承担相应的法律责任。

4. 建议与风险提示

• 对于卖方或出租方：在签订合同时，应明确约定打款时间、方式等关键条款，以避免后续纠纷。如果中介提出延迟打款的要求，应谨慎考虑并要求其提供合理的解释和担保措施。
• 对于中介：应严格遵守合同约定和法律法规的规定，及时、足额地将款项支付给卖方或出租方。如果确实需要延迟打款，应提前与卖方或出租方协商并取得其同意，同时签订书面协议明确双方的权利和义务。

总结：中介收房三个月后打款是否合法，需结合合同条款、交易习惯以及相关法律法规来综合判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。