结论：中介称下款后先打款到公司是否合法不能一概而论，需分情况判断，具体如下：

1. 若公司为合法中介且与借款人、出借方有明确约定，且约定不违反法律强制性规定，则合法
   根据《民法典》第465条，依法成立的合同受法律保护，对当事人具有法律约束力。若中介公司作为居间方，与借款人、出借方签订书面合同，明确约定“贷款发放后，款项先打入公司账户用于特定用途（如代扣手续费、保证金等）”，且该约定不违反《民法典》第153条（禁止违反法律、行政法规强制性规定）及第154条（禁止恶意串通损害他人权益），则该行为具有合法性。例如，部分银行与中介合作贷款时，会要求中介代扣评估费、担保费等，此类操作需以合同明确约定为前提。

2. 若公司无合法资质或约定违反法律强制性规定，则不合法

   • 无资质经营：根据《银行业监督管理法》第19条，未经国务院银行业监督管理机构批准，任何单位或个人不得设立银行业金融机构或从事银行业金融机构的业务活动。若中介公司未取得金融业务许可，却以“打款到公司”为名截留、挪用贷款资金，可能涉嫌非法经营罪（《刑法》第225条）。
     
   • 变相收费或欺诈：若中介以“打款到公司”为名，实际收取高额“砍头息”（如贷款10万元，实际到手8万元，2万元被中介扣留），则违反《民法典》第670条（禁止预扣利息）及《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第26条（利息不得预先扣除），借款人可要求按实际到账金额返还本金并支付利息。
     
   • 挪用资金：若中介将打入公司账户的贷款资金用于非约定用途（如投资、挥霍），可能涉嫌挪用资金罪（《刑法》第272条），借款人可向公安机关报案。

3. 风险提示与建议

   • 核实中介资质：要求中介出示营业执照、金融业务许可证（如涉及贷款业务），并通过国家企业信用信息公示系统、银保监会官网等渠道查询其合法性。
     
   • 审查合同条款：仔细阅读与中介、出借方签订的合同，重点关注“打款到公司”的具体用途、金额、期限及违约责任，避免签署模糊条款。
     
   • 保留证据：若发现中介存在违规行为，立即保存合同、转账记录、聊天记录等证据，并向当地金融监管部门（如银保监局、地方金融监管局）举报，或通过诉讼、仲裁维护权益。

总结：中介“下款后先打款到公司”的合法性取决于其资质、合同约定及资金用途。若您遇到此类情况，可直接向我提供具体合同条款、中介信息等，我将进一步分析其合法性并给出维权建议。