施工单位不服从甲方管理，甲方可以采取以下措施来应对：

1. 依据合同条款处理：

   • 合同审查：首先，甲方应仔细审查与施工单位签订的合同，特别是关于施工单位义务、违约责任以及甲方权利等条款。合同是双方行为的准则，明确规定了双方的权利和义务。
   • 违约处理：如果施工单位的行为违反了合同中的明确规定，甲方有权依据合同条款要求施工单位承担违约责任，包括但不限于罚款、赔偿损失、解除合同等。

2. 沟通协调与警告：

   • 及时沟通：甲方应与施工单位进行及时、有效的沟通，了解施工单位不服从管理的原因，尝试通过协商解决问题。
   • 书面警告：如果沟通无果，甲方可以向施工单位发出书面警告，明确指出其不服从管理的行为及可能产生的后果，要求施工单位立即改正。

3. 采取行政或法律手段：

   • 行政投诉：如果施工单位的行为严重违反了相关法律法规或行业规范，甲方可以向相关行政主管部门投诉，请求行政主管部门对施工单位进行处罚或监管。
   • 法律诉讼：在极端情况下，如果施工单位的行为给甲方造成了重大损失，且无法通过其他方式解决，甲方可以考虑通过法律诉讼来维护自己的合法权益。这包括向法院提起诉讼，要求施工单位承担民事责任，如赔偿损失、恢复原状等。

4. 考虑合同解除与重新招标：

   • 合同解除：如果施工单位的行为严重违反了合同约定，且无法通过其他方式纠正，甲方有权依据合同条款解除合同，并要求施工单位承担因此产生的所有损失。
   • 重新招标：在合同解除后，甲方可以考虑重新招标，选择新的施工单位来完成工程任务。这有助于确保工程的顺利进行和甲方的利益不受进一步损害。

在处理此类问题时，甲方还需注意以下几点：

• 保留证据：甲方应妥善保留与施工单位沟通、协调以及施工单位不服从管理的相关证据，如邮件、短信、会议记录、照片、视频等。这些证据在后续处理纠纷时将起到关键作用。
• 合法合规：甲方在处理施工单位不服从管理的问题时，应确保自己的行为合法合规，避免采取过激或违法的手段，以免给自己带来不必要的法律风险。
• 寻求专业支持：如果甲方在处理此类问题时感到困惑或无法应对，可以寻求专业律师或法律机构的支持，以确保自己的权益得到充分保护。

最后，建议甲方在未来的合同签订和项目管理中，更加注重合同条款的明确性和可执行性，以及项目管理的规范性和有效性，以减少类似纠纷的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。