结论：竞业协议补偿可以通过工资结构分出一项补助的形式来支付，但需满足特定条件，且存在一定法律风险需谨慎操作。以下从不同角度详细分析：

从合同自由与意思自治角度

1. 合同约定优先：在劳动关系中，用人单位与劳动者在签订劳动合同时，基于合同自由和意思自治原则，双方可以对竞业限制补偿金的支付方式进行协商约定。如果双方在劳动合同或者竞业限制协议中明确约定，将竞业限制补偿金以工资结构中的某一项补助形式按月支付给劳动者，这种约定在法律上一般是有效的。例如，双方约定每月工资中包含一定金额作为竞业限制补偿，只要该约定不违反法律法规的强制性规定，就应当得到尊重和履行。
2. 明确约定内容：为了确保约定的有效性和可操作性，双方需要在协议中详细明确该补助的性质、金额、支付方式以及与竞业限制义务的关联等内容。比如，明确说明该补助是专门用于补偿劳动者在竞业限制期间可能遭受的经济损失，且金额是根据劳动者的工作岗位、薪资水平以及竞业限制的范围和期限等因素合理确定的。

从法律强制性规定角度

1. 补偿金支付时间要求：根据《劳动合同法》规定，在解除或者终止劳动合同后，用人单位应在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。如果将竞业限制补偿金包含在工资中按月发放，可能会面临一个问题，即工资是在劳动关系存续期间支付的，而竞业限制是在劳动关系解除或终止后才开始生效的。因此，这种支付方式可能会被认为不符合法律规定的支付时间要求，存在被认定为无效约定的风险。
2. 补偿金独立性要求：竞业限制补偿金是对劳动者在竞业限制期间放弃就业机会、遭受经济损失的一种补偿，具有独立性。如果将其与工资混同，可能会模糊补偿金的性质，导致在发生纠纷时难以确定补偿金的实际支付情况。例如，当用人单位主张已经支付了竞业限制补偿金，而劳动者认为该部分金额只是工资的正常组成部分时，就容易产生争议。

从司法实践角度

1. 部分地区认可：在一些地区的司法实践中，如果用人单位能够提供充分的证据证明双方明确约定了工资中的某一项补助为竞业限制补偿金，并且该补偿金的金额合理，能够满足劳动者在竞业限制期间的基本生活需求，法院可能会认可这种支付方式。例如，用人单位提供了劳动合同、竞业限制协议、工资发放记录等证据，证明双方在签订协议时已经就补偿金的支付方式达成了一致，且补偿金的金额符合当地的生活水平和行业惯例。
2. 举证责任重要：然而，在司法实践中，用人单位承担着较重的举证责任。如果用人单位无法提供充分的证据证明工资中的补助就是竞业限制补偿金，或者该补偿金的金额明显过低，无法达到补偿的目的，法院可能会不支持用人单位的主张，认定用人单位未按照法律规定支付竞业限制补偿金。

操作建议

1. 谨慎约定支付方式：用人单位在与劳动者约定竞业限制补偿金的支付方式时，应谨慎考虑将补偿金包含在工资中的做法。如果确实需要采用这种方式，应当在劳动合同和竞业限制协议中明确约定补助的性质、金额和支付方式，并确保该约定符合法律法规的规定。
2. 保留相关证据：用人单位应保留好与竞业限制补偿金支付相关的所有证据，如劳动合同、竞业限制协议、工资发放记录、劳动者确认收到补偿金的签字文件等，以便在发生纠纷时能够提供充分的证据证明自己的主张。
3. 定期评估补偿金额：用人单位应定期评估竞业限制补偿金的金额是否合理，是否能够满足劳动者在竞业限制期间的基本生活需求。如果补偿金额过低，可能会导致劳动者不愿意遵守竞业限制义务，或者引发劳动纠纷。

如果你在竞业协议补偿支付方面还有其他疑问，或者遇到了相关的法律纠纷，欢迎随时向我咨询。