核心结论：购车合同本身无法直接证明发票低开，但可以通过合同中的价格条款、付款方式条款、违约责任条款等设计，结合其他证据（如付款记录、沟通记录等），间接证明发票金额低于实际交易价格。以下是具体分析：

1. 购车合同中的价格条款设计

• 明确约定实际交易价格：在合同中清晰写明车辆的实际成交价格（如“车辆总价款为人民币XX万元”），并注明该价格包含的税费、保险、上牌费等具体项目。若发票金额低于该价格，合同中的价格条款可作为实际交易价格的直接证据。
• 区分价款与税费：若发票低开涉及偷逃税费，可在合同中明确约定“买方实际支付价款为XX万元，其中发票金额为XX万元，差额部分以其他方式支付”。但需注意，此类条款可能因涉嫌违法而无效，且可能引发税务风险。

2. 付款方式条款的佐证作用

• 约定分期付款或额外付款：在合同中约定买方需通过银行转账、支付宝等方式支付部分款项，并注明该款项与发票金额的差额（如“买方需额外支付XX万元至卖方指定账户”）。付款记录可作为实际交易价格的辅助证据。
• 避免现金交易：若涉及现金支付，需在合同中明确记录现金支付的金额、时间、地点，并要求卖方出具收据。现金交易因难以留痕，证明力较弱，建议尽量避免。

3. 违约责任条款的约束

• 约定发票金额与实际不符的违约责任：在合同中增加条款，如“若卖方开具的发票金额低于实际交易价格，买方有权要求卖方补开发票或赔偿损失”。此类条款可倒逼卖方如实开具发票，同时为后续维权提供依据。

4. 其他证据的补充

• 沟通记录：保留与卖方沟通发票金额的聊天记录、邮件、录音等，证明双方曾就实际交易价格达成一致，但发票金额被低开。
• 第三方证据：如车辆评估报告、同型号车辆市场价格查询记录等，证明发票金额明显低于市场合理价格。

5. 风险提示

• 税务合规性：低开发票可能涉及偷逃税费，买方可能面临补缴税款、罚款甚至刑事责任。建议谨慎操作，避免参与违法活动。
• 合同效力：若合同中明确约定低开发票或偷逃税费，该条款可能因违反法律强制性规定而被认定无效，但不影响合同其他条款的效力。

建议：若发现发票被低开，可首先与卖方协商补开发票或赔偿损失；若协商无果，可收集合同、付款记录、沟通记录等证据，通过诉讼或投诉（如向税务机关举报）维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。