结论：在赔偿协议已签字的情况下，是否可以不参加司法确认，这主要取决于协议的具体内容、双方当事人的意愿以及相关法律法规的规定。一般来说，司法确认并非强制程序，但如果协议中有明确约定或法律有特别规定，则可能需要参加。以下从不同角度进行详细分析：
一、司法确认的性质与目的
司法确认是人民法院对当事人之间已经达成的调解协议进行审查，并确认其法律效力的程序。其目的在于通过司法权力的介入，增强调解协议的强制执行力，保障当事人的合法权益。然而，司法确认并非所有调解协议的必经程序，它更多地是依赖于当事人的自愿申请。
二、赔偿协议中的约定
如果赔偿协议中明确约定了需要司法确认：
- 在这种情况下，双方当事人应当按照协议的约定，共同向人民法院申请司法确认。如果一方不参加，可能构成违约，需要承担相应的法律责任。
如果赔偿协议中没有明确约定需要司法确认：
- 双方当事人可以自行选择是否申请司法确认。如果一方不愿意参加司法确认程序，另一方不能强迫其参加。但需要注意的是，未经司法确认的调解协议，其强制执行力可能相对较弱，如果一方不履行协议，另一方可能需要通过诉讼等途径来维护自己的权益。
三、法律法规的规定
对于特定类型的调解协议：
- 如劳动争议调解协议、人民调解协议等，根据相关法律法规的规定，可能需要在一定期限内申请司法确认，以增强其法律效力。在这种情况下，如果赔偿协议属于这些特定类型，且双方当事人已经签字，那么可能需要按照法律规定参加司法确认程序。
对于一般性的赔偿协议：
- 法律法规并未明确规定必须申请司法确认。因此，在这种情况下，是否参加司法确认程序更多地取决于双方当事人的意愿和协议的具体内容。
四、实际操作中的建议
仔细审查赔偿协议：
- 在签字前，双方当事人应当仔细审查协议的内容，特别是关于司法确认的条款。如果协议中有明确约定需要司法确认，那么应当做好相应的准备。
咨询专业律师：
- 如果对司法确认程序或赔偿协议的内容有疑问，建议咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见，帮助当事人做出明智的决策。
考虑协议的强制执行力：
- 如果希望赔偿协议具有更强的强制执行力，那么可以考虑申请司法确认。但如果对协议的履行有信心，或者认为通过其他途径（如诉讼）也能有效维护自己的权益，那么也可以选择不申请司法确认。
最后，是否参加司法确认程序取决于多种因素，包括赔偿协议的具体内容、双方当事人的意愿以及相关法律法规的规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。