当公司员工被确诊为癌症时，公司需要采取一系列措施来妥善处理这一问题，确保既符合法律法规要求，又体现出对员工的人文关怀。以下是一些建议的处理方式：

一、确定医疗期

首先，公司需要根据员工的实际工作年限和在本单位的工作年限，来确定其应享受的医疗期。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》及相关通知，对于患特殊疾病（如癌症）的职工，在24个月内尚不能痊愈的，经企业和劳动主管部门批准，可以适当延长医疗期。这意味着，癌症员工通常可以享有较长的医疗期，具体时长需根据员工实际情况和当地政策来确定。

二、支付医疗期工资

在医疗期内，公司需要按照劳动合同和集体合同的约定，向员工支付病伤假工资。根据《安徽省工资支付规定》等相关规定，病伤假工资不得低于当地最低工资标准的80%。这一标准确保了员工在医疗期内能够获得基本的生活保障。

三、缴纳社保

在医疗期内，公司仍需为员工缴纳社保。社保缴纳基数通常依据员工的实际工资来确定。如果员工的工资在医疗期内降低为最低工资标准的80%，那么社保缴纳基数也应相应调整。这确保了员工在医疗期内仍能享受到社保的保障。

四、沟通与关怀

除了法律层面的处理外，公司还应积极与员工进行沟通，了解其病情和治疗情况，提供必要的关怀和支持。例如，可以安排专人负责与员工联系，了解其需求，提供心理疏导等。同时，公司也可以考虑为员工提供一些额外的帮助，如协助申请医疗救助、提供交通补贴等。

五、合法解除劳动合同（如需）

如果员工在医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作，那么公司可以根据《劳动合同法》的相关规定，提前30日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工1个月工资后，解除劳动合同。但在此过程中，公司必须确保程序合法，避免构成违法解除劳动合同。

六、案例参考

以付某案例为例，A公司在付某治疗期间解除劳动合同，由于付某患特殊疾病且医疗期未满，A公司的行为构成违法解除。经仲裁委调解，A公司支付了违法解除劳动合同赔偿金。这一案例提醒公司，在处理癌症员工问题时，必须严格遵守法律法规，确保员工的合法权益得到保障。

综上所述，当公司员工被确诊为癌症时，公司应首先确定医疗期，支付医疗期工资，缴纳社保，并积极与员工进行沟通与关怀。如需解除劳动合同，必须确保程序合法。通过这些措施，公司可以妥善处理癌症员工问题，维护员工的合法权益，同时体现公司的人文关怀和社会责任。