结论：停薪留职期间能否去部队服役，需结合停薪留职的性质、劳动合同约定及法律法规综合判断，具体分两种情况分析：

1. 若停薪留职属于“保留劳动关系”的合法情形

根据《劳动合同法》及相关规定，停薪留职通常指企业与员工协商一致，暂时中止劳动合同履行但保留劳动关系（如因员工个人原因申请、企业因经营需要安排等）。此时：

• 若劳动合同或停薪留职协议中明确约定员工可在此期间参军，则员工可依法履行兵役义务，且企业需保留其劳动关系至服役期满（依据《兵役法》第55条，义务兵和士官服役期间，原单位应保留其劳动关系）。
• 若协议未约定或明确禁止，员工需与企业协商一致后方可参军，否则可能构成违约，企业有权依据协议追究责任（如要求赔偿损失或解除劳动关系）。

建议：

• 优先查阅劳动合同、停薪留职协议中的具体条款；
  
• 若无明确约定，可与企业协商补充协议，明确参军期间的权利义务（如保留工龄、社保缴纳等）。

2. 若停薪留职属于“事实劳动关系中止”的模糊情形

部分企业可能以“停薪留职”名义变相解除劳动关系（如未签订书面协议、停发工资且未缴纳社保）。此时：

• 劳动关系可能被认定为已解除，员工参军需以“社会青年”身份报名，服役期满后不享受原单位复职权利；
  
• 若企业存在违法解除行为（如未出具解除证明、未办理社保转移），员工可依据《劳动合同法》第48条主张继续履行合同或要求赔偿。

建议：

• 收集证据（如工资条、社保记录、沟通记录）证明劳动关系存续；
  
• 向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，确认劳动关系状态后再决定参军事宜。

关键法律依据

1. 《兵役法》第55条：义务兵和士官入伍前是机关、团体、企业事业单位工作人员的，服役期间原单位应当保留其劳动关系或工作岗位；
   
2. 《劳动合同法》第35条：变更劳动合同需双方协商一致；
   
3. 《劳动合同法》第48条：用人单位违法解除劳动合同的，劳动者可要求继续履行或赔偿。

总结：停薪留职期间参军需以“保留劳动关系”为前提，建议先明确协议条款或劳动关系状态，再通过协商或法律途径保障权益。如有具体协议或纠纷，可进一步向我提供细节，我会为您分析风险点。