当您的停工留薪期已经结束，但工伤尚未痊愈，且您对工资待遇存在疑问时，您可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：
一、了解并确认相关法律规定
首先，根据《工伤保险条例》及相关规定，停工留薪期一般不超过12个月，特殊情况下经确认可以适当延长，但延长不得超过12个月。在停工留薪期内，您的原工资福利待遇应保持不变，由所在单位按月支付。若停工留薪期满后您仍需治疗，您应继续享受工伤医疗待遇。
二、核对停工留薪期工资
确认工资构成：您需要核对自己的工资构成，确保单位在计算停工留薪期工资时包含了所有应得部分，如计时工资或计件工资、奖金、津贴和补贴等。
对比前后工资：将停工留薪期工资与您受伤前的正常工资进行对比。如果发现存在差额，您应进一步了解原因，并确认单位是否按照法律规定支付了停工留薪期工资。
三、申请延长停工留薪期（如需）
若您的伤情在停工留薪期内未能痊愈，且需要继续治疗或康复，您可以向用人单位或当地社会保险行政部门提出延长停工留薪期的申请。申请时，通常需要提交医疗机构出具的诊断证明、病历等相关材料，以证明伤情的严重性和继续治疗的必要性。经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认后，您的停工留薪期可以适当延长。
四、进行劳动能力鉴定
如果停工留薪期已满且无法再延长，或者您认为自己的伤情已经稳定，您可以进行劳动能力鉴定。通过劳动能力鉴定，可以确定您的伤残等级，为后续的工伤赔偿提供依据。您需要向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出申请，并提交相关材料。
五、与单位协商沟通
提出异议：一旦发现停工留薪期工资不对或工伤待遇存在问题，您应及时向单位提出异议，要求单位解释原因并进行更正。
协商解决：在沟通过程中，您可以表达自己的诉求和依据，尝试与单位达成和解。如果单位同意更正工资或提供合理的工伤待遇，问题可能得到迅速解决。
六、申请劳动仲裁或提起诉讼
申请劳动仲裁：如果与单位协商无果，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁前，请准备好相关证据材料，如工资条、银行流水、劳动合同、工伤认定决定书等。仲裁委员会将根据双方提供的证据和陈述进行裁决。
提起诉讼：如果您对仲裁结果不满意，可以在收到仲裁裁决书之日起15日内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，请继续提供证据支持自己的主张，并遵循法院的审理程序。
七、寻求法律援助（如需）
如果您在经济上存在困难或法律知识不足，可以寻求法律援助机构的帮助。法律援助机构将为符合条件的您提供免费的法律咨询和代理服务，帮助您更好地维护自己的合法权益。
八、注意事项
在整个维权过程中，请务必保留好相关证据材料，以便在需要时提供证明。同时，发现停工留薪期工资不对或工伤待遇存在问题后，请及时采取行动维护自己的权益，避免错过最佳维权时机。