核心结论：肇事方不认可交通事故伤残鉴定结果并申请重新鉴定，一般不会直接影响之前初次鉴定结果的法律效力，但最终赔偿等处理会以重新鉴定结果为准（若重新鉴定被采信）。 以下是具体分析：

从初次鉴定结果法律效力角度

初次交通事故伤残鉴定是由有资质的鉴定机构和鉴定人依据法定程序作出的，在未被依法推翻之前，它具有法律效力。肇事方不认可并申请重新鉴定，这并不意味着初次鉴定结果就失去了其应有的作用和地位。初次鉴定结果依然是证明受害者伤残情况的重要证据之一，在后续的诉讼等程序中，法院等有权机关会将其作为参考依据之一。

例如，在一些交通事故赔偿纠纷案件中，即使肇事方提出了重新鉴定申请，在重新鉴定结果出来之前，初次鉴定结果对于确定受害者的基本伤情、大致的赔偿范围等都有一定的参考价值。而且，如果重新鉴定申请不符合法定条件，比如没有合理的理由或者未按照法定程序提出，那么初次鉴定结果将继续作为有效的证据使用。

从重新鉴定结果影响角度

如果肇事方申请重新鉴定且符合法定条件，相关部门会委托其他有资质的鉴定机构进行重新鉴定。一旦重新鉴定结果作出，且该结果被法院等有权机关采信，那么最终在确定交通事故赔偿责任等方面，将以重新鉴定结果为依据。

这是因为重新鉴定是在对初次鉴定可能存在的问题进行审查和纠正的基础上进行的，其目的就是为了更准确地确定受害者的伤残情况。例如，如果初次鉴定由于鉴定人经验不足或者鉴定方法不当等原因，导致伤残等级评定不准确，重新鉴定纠正了这一问题，那么法院在判决赔偿金额时，就会依据重新鉴定确定的伤残等级来计算赔偿数额，而不是依据初次鉴定结果。

从诉讼程序角度

在交通事故赔偿诉讼中，如果肇事方对初次鉴定结果不认可并申请重新鉴定，法院会根据具体情况决定是否准许。如果准许重新鉴定，在重新鉴定期间，诉讼程序一般不会停止，但会等待重新鉴定结果出来后再继续进行后续的审理和判决。

比如，在庭审过程中，肇事方提出重新鉴定申请，法院审查后认为有必要重新鉴定，就会中止对伤残赔偿部分的审理，委托重新鉴定。待重新鉴定结果出来后，恢复审理，并根据重新鉴定结果确定最终的赔偿责任。

建议：如果遇到这种情况，受害者要积极配合重新鉴定工作，同时保存好初次鉴定的相关材料，以备在诉讼中充分维护自己的合法权益。要是对鉴定程序、结果等方面有任何疑问，都可以直接向我咨询。