行政处罚中，多个机构针对同一或不同违法行为，一般不能共同下一个处罚决定，但可以分别下达多个处罚决定书；同时，同一个机构针对多个关联违法行为也可以合并在一个处罚决定书中处理。以下是对这一问题的详细分析：

1. 多个机构分别下达处罚决定书：

   • 当多个违法行为由不同的行政机关依据各自法律法规进行查处时，由于执法主体和权限的差异，通常会分别作出并下达处罚决定书。例如，环保部门和市场监管部门针对企业的不同违法行为分别立案调查并下达处罚。这种情况下，每个机构都独立行使自己的执法权，对各自查处的违法行为进行处罚。

2. 同一个机构分别下达处罚决定书：

   • 若同一个行政机关查处的多个违法行为在性质、构成要件和法律适用上明显不同，且相互之间没有紧密关联，行政机关会分别对每个违法行为进行认定并下达相应的处罚决定书。比如，一个企业既存在环境污染问题，又存在偷税漏税问题，环保部门和税务部门（若税务部门也参与查处，但此处以同一机构内不同执法领域为例说明，实际中可能由不同机构处理）会分别针对这两个问题下达处罚决定书。不过，若是一个行政机关内部的不同部门或执法人员查处，且违法行为独立，也会分别下达处罚决定。

3. 同一个机构合并下达处罚决定书：

   • 对于同一个行政机关查处的多个违法行为，如果它们之间存在一定关联性，如基于同一违法故意或同一事件引发，为了提高执法效率并减轻相对人负担，行政机关可以将这些违法行为合并在一份处罚决定书中进行处理。例如，运输公司司机在同一次运输过程中既超载又超速，交通运输管理部门可以在一个处罚决定书中同时处理这两个违法行为。此外，在某些特定情形下，法律法规可能规定多个相关违法行为视为一个违法行为进行处理，此时行政机关也会在一份处罚决定书中对这些行为进行综合处理。

法律建议与注意事项：

• 行政机关在处理多个违法行为时，应充分考虑违法行为的性质、情节以及相互之间的关系，以确保处罚的公正性和准确性。
• 无论选择分别下达处罚决定书还是合并处理，都必须确保处理的合法性和合理性，不得侵犯当事人的合法权益。这要求行政机关在作出处罚决定时，必须遵循法定程序，充分听取当事人的陈述和申辩，确保处罚决定有充分的事实和法律依据。
• 如果在实际生活中遇到类似问题，比如对多个机构的处罚决定有异议，或者对同一个机构合并处罚的决定不服，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律意见和帮助。

综上所述，行政处罚中多个机构或同一个机构针对多个违法行为的处理方式并非一成不变，而是需要根据具体情况灵活选择。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。