员工工作不满三个月因能力不足被开除，是否有赔偿需根据具体情况判断，关键在于用人单位的辞退行为是否合法以及是否履行了法定程序。以下是对这一问题的详细分析：
合法辞退与经济补偿
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条的规定，如果员工不能胜任工作，用人单位应首先对其进行培训或者调整工作岗位。经过培训或调岗后，员工仍然不能胜任工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。
- 在这种情况下，用人单位需要支付经济补偿。经济补偿的计算依据是员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
- 举例：假设员工小张在公司工作了2个月，月工资为5000元，因能力不足被辞退，且公司已履行了培训或调岗等法定程序，那么公司应支付给小张的经济补偿为半个月工资，即2500元。
违法辞退与赔偿金
- 如果用人单位未经培训或调岗直接以工作能力不足为由辞退员工，或者未能提供充分、有效的证据证明员工工作能力不符合要求而辞退员工，这种辞退行为可能构成违法解除劳动合同。
- 在此情况下，劳动者可以要求用人单位按照经济补偿标准的二倍向其支付赔偿金。赔偿金的计算公式为：赔偿金 = 经济补偿 × 2。
- 举例：假设员工小李在公司工作了2个月，月工资为5000元，因能力不足被违法辞退，那么小李可以要求公司支付的赔偿金为经济补偿的两倍，即2500元 × 2 = 5000元。
举证责任
- 用人单位在主张员工工作能力不足时，需承担举证责任，即提供充分、有效的证据来证明员工不能胜任工作。这包括但不限于绩效考核结果、工作表现记录等。
- 如果用人单位无法提供足够的证据来支持其辞退决定，那么其辞退行为可能被认定为违法，从而需要支付赔偿金。
劳动合同约定
- 在处理因工作能力不足被辞退的纠纷时，还需考虑劳动合同中的相关约定条款。如果劳动合同中有关于工作能力和辞退的具体规定，这些规定将作为判断用人单位辞退行为是否合法的重要依据。
建议：
- 对于用人单位而言，在辞退员工前应确保辞退行为合法且履行了法定程序，以避免支付不必要的赔偿金。
- 对于劳动者而言，如果认为用人单位的辞退行为违法，可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
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