结论：合作社理事长是否可以担任民办非企业监事，需结合具体法律法规及民办非企业的章程规定来判断，一般情况下，若不存在利益冲突和违反禁止性规定，是可以担任的，但也存在不能担任的特殊情况。以下为详细分析：
一、法律法规层面的一般性分析
无直接禁止性规定：
- 目前，我国并没有明确的法律法规直接规定合作社理事长不得担任民办非企业的监事。因此，从法律条文的角度来看，不存在直接的禁止性障碍。
利益冲突与回避原则：
- 尽管没有直接禁止，但合作社理事长在担任民办非企业监事时，需考虑是否存在利益冲突。如果合作社与民办非企业之间存在业务往来、经济利益关联或其他可能影响公正判断的情形，那么理事长担任监事可能会引发利益冲突问题。
- 在这种情况下，应遵循利益冲突回避原则，避免理事长同时担任可能产生利益冲突的职位。
民办非企业章程的规定：
- 民办非企业的章程是其内部治理的基本准则，其中可能包含对监事任职资格、选举程序、职权范围等方面的具体规定。
- 因此，在判断合作社理事长是否可以担任民办非企业监事时，应首先查阅并遵守民办非企业的章程规定。
二、特殊情况分析
特定行业或领域的限制：
- 某些特定行业或领域的民办非企业可能受到更严格的监管要求，其章程或相关法规可能明确规定了监事的任职资格和限制条件。
- 在这种情况下，合作社理事长是否可以担任监事，需根据具体行业或领域的规定来判断。
合作社与民办非企业的关系：
- 如果合作社与民办非企业之间存在控股、参股、合作等紧密关系，或者存在其他可能影响监事独立性的情形，那么理事长担任监事可能会受到更严格的审查。
- 在这种情况下，应谨慎评估理事长担任监事的合适性，并考虑采取必要的措施来确保监事的独立性和公正性。
三、法律建议
查阅相关法律法规和章程：
- 在决定合作社理事长是否可以担任民办非企业监事之前，应首先查阅相关的法律法规和民办非企业的章程规定，确保符合所有任职资格和条件。
评估利益冲突：
- 对合作社与民办非企业之间的关系进行全面评估，识别可能存在的利益冲突点，并采取必要的措施来避免或解决这些冲突。
遵循民主程序：
- 如果民办非企业的章程规定了监事的选举程序，应确保理事长的任命过程遵循这些程序，保证选举的公正性和合法性。
咨询专业意见：
- 在涉及复杂法律问题或不确定情形时，建议咨询专业律师或法律机构的意见，以确保决策的合法性和合规性。
如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。