针对您提出的“城镇生活污泥倾倒在耕地上怎么处理和认定”的问题，这是一个涉及环境保护和土地管理的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、行为认定
非法占用农用地：根据《中华人民共和国刑法》第三百四十二条的规定，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，构成非法占用农用地罪。城镇生活污泥倾倒在耕地上，显然改变了土地的原有用途，且可能对土地造成严重破坏，因此可以认定为非法占用农用地行为。
危害农田水利设施：如果污泥倾倒行为还涉及到了农田水利设施，如排水沟、灌溉渠道等，那么该行为还可能违反《农田水利条例》等相关法规。这些法规明确禁止向塘坝、沟渠排放污水、倾倒垃圾以及其他废弃物，因为这些行为会危害农田水利设施的正常运行。
二、法律责任
刑事责任：对于非法占用农用地并造成严重毁坏的行为，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可以判处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。在您提到的案例中，不法分子因非法占用农用地并造成耕地种植条件重度损毁，被法院判处了相应的刑罚。
民事责任：除了刑事责任外，非法占用农用地的行为人还需要承担民事责任，包括赔偿土地所有者的损失、恢复土地原状等。在案例中，法院要求不法分子共同对破坏的两处农田、林地等进行生态修复，并缴纳了土地修复保证金。
行政责任：对于违反环境保护和土地管理法规的行为，相关行政主管部门还可以依法给予行政处罚，如罚款、责令停止违法行为、限期恢复原状等。
三、处理措施
立即停止违法行为：一旦发现城镇生活污泥倾倒在耕地上的行为，应立即停止该行为，防止对土地造成进一步破坏。
报告相关部门：及时向当地环保、土地管理等部门报告该行为，以便相关部门能够迅速介入调查并采取措施。
配合调查处理：积极配合相关部门的调查处理工作，提供必要的证据和信息，以便相关部门能够准确认定行为性质并依法处理。
生态修复：如果土地已经受到破坏，应按照相关要求进行生态修复工作，恢复土地的原状和功能。
四、预防措施
加强监管：相关部门应加强对城镇生活污泥处理、运输和倾倒的监管力度，防止非法倾倒行为的发生。
提高公众意识：通过宣传教育等方式提高公众对土地保护和环境保护的意识，鼓励公众积极参与监督举报非法倾倒行为。
完善法规制度：进一步完善相关法规制度，明确非法倾倒行为的法律责任和处罚措施，为打击非法倾倒行为提供有力的法律保障。
综上所述，城镇生活污泥倾倒在耕地上是一种严重的违法行为，需要依法进行认定和处理。通过加强监管、提高公众意识、完善法规制度等措施，我们可以有效预防和打击这种违法行为，保护我们的土地资源和生态环境。