针对您提出的“双方合同都修改，但修改部分未签字是否有效”的问题，这主要取决于修改的内容、方式以及双方的真实意图和交易习惯。以下是我从不同角度为您进行的分析：
合同修改的基本原则：
- 合同一旦成立并生效，对双方均具有法律约束力。若需修改合同内容，通常应经双方协商一致，并以书面形式进行确认，即双方在修改后的合同文本上签字或盖章，以体现双方对修改内容的认可和接受。
修改部分未签字的有效性分析：
- 若修改部分未签字，但双方已实际履行：根据《民法典》的相关规定，如果双方已经按照修改后的内容实际履行了合同，且没有提出异议，那么可以视为双方对修改内容已经达成了一致，修改部分具有法律效力。这种情况下，即使未签字，也不影响修改部分的效力。
- 若修改部分未签字，且双方未实际履行：在这种情况下，由于双方未就修改内容达成书面一致，且未实际履行，因此修改部分通常不具有法律效力。如果一方主张修改部分有效，需要承担举证责任，证明双方已经就修改内容达成了一致。
- 特殊情形下的效力认定：如果合同中明确约定了修改合同的方式或程序，如必须通过特定方式（如电子邮件、传真等）进行确认，或者必须由特定人员签字等，那么未按照约定方式或程序进行的修改，可能不被认定为有效。
法律建议：
- 明确修改程序：为了避免未来可能出现的纠纷，建议在合同中明确约定修改合同的方式和程序，包括修改的提出、协商、确认等环节。
- 及时签字确认：如果双方对合同内容进行了修改，应及时在修改后的合同文本上签字或盖章，以体现双方对修改内容的认可和接受。
- 保留证据：在修改合同过程中，建议双方保留好相关的沟通记录、邮件、传真等证据，以备不时之需。
总结来说，双方合同都修改但修改部分未签字是否有效，取决于多种因素，包括修改的内容、方式、双方的真实意图和交易习惯等。为了避免未来可能出现的纠纷，建议双方在修改合同时遵循明确的程序和方式，并及时签字确认。如果您在合同修改过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。