医疗机构将药房承包出去属于违法行为，会面临行政处罚，情节严重的相关责任人还可能承担刑事责任。具体分析如下：
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》以及《医疗机构管理条例》等相关法律法规，医疗机构不得将药房承包给个人或其他单位经营。若违反此规定，卫生健康行政部门将依法对医疗机构进行处罚，包括但不限于警告、罚款、没收违法所得、责令停业整顿等。
- 处罚的具体力度会根据违法行为的情节轻重、造成的后果以及医疗机构的整改情况等因素综合考量。例如，若承包行为导致患者用药安全受到威胁或造成其他严重后果，处罚将会更为严厉。
刑事责任：
- 在某些极端情况下，如果医疗机构将药房承包出去的行为涉及到了药品质量、安全等严重问题，且造成了重大损失或社会影响，相关责任人还可能面临刑事责任的追究。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如涉及生产、销售假药、劣药等犯罪行为，将依法对责任人进行刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。
其他后果：
- 除了行政处罚和刑事责任外，医疗机构还可能因药房承包行为而面临声誉损失、患者信任度下降等间接后果。这些后果虽然难以量化，但对医疗机构的长期发展无疑是不利的。
建议：医疗机构应严格遵守相关法律法规，不得将药房承包给个人或其他单位经营。若已存在承包行为，应立即停止并整改，以确保患者用药安全和维护医疗机构的良好形象。如果医疗机构在药房管理方面遇到法律难题，可以直接向我咨询，我会结合具体情况提供专业的法律建议。