医疗机构销售药品若存在违法行为，将面临行政、民事及刑事三方面的法律责任，具体处罚规定依据药品性质及违法情节的严重程度而定。以下是对不同情况的详细分析：
一、销售假药
行政责任：
- 根据《中华人民共和国药品管理法》，医疗机构销售假药，将被没收违法销售的药品及违法所得，并处以违法销售药品货值金额的十五倍以上三十倍以下的罚款；货值金额不足十万元的，按十万元计算。
- 情节严重者，还将被责令停产停业整顿，甚至吊销《药品经营许可证》或医疗机构执业许可证。
民事责任：
- 若假药导致患者人身损害，医疗机构需赔偿患者因此产生的医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金等损失。
刑事责任：
- 依据《中华人民共和国刑法》第一百四十一条，销售假药但未造成严重危害的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
- 若对人体健康造成严重危害或有其他严重情节，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
- 致人死亡或有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑，并处罚金或没收财产。
二、销售劣药
行政责任：
- 根据《中华人民共和国药品管理法》第一百一十七条，生产、销售劣药的，将被没收违法生产、销售的药品和违法所得，并处违法生产、销售的药品货值金额十倍以上二十倍以下的罚款；货值金额不足十万元的，按十万元计算。
- 情节严重的，还将被责令停产停业整顿，直至吊销药品批准证明文件、药品生产许可证、药品经营许可证或医疗机构制剂许可证。
民事责任：
- 与销售假药类似，若劣药导致患者人身损害，医疗机构需承担相应的赔偿责任。
刑事责任：
- 虽然销售劣药本身不直接构成犯罪，但若劣药导致严重后果，如多人伤亡或重大公共卫生事件，相关责任人员可能因涉嫌其他犯罪（如过失致人死亡罪）而承担刑事责任。
三、特殊情形下的免责
- 若医疗机构能证明其进货渠道合法，履行了进货查验与销售记录的义务，且不知道所销售的药品是假药或劣药，根据相关规定，可能免除其他行政处罚，但仍需没收违法销售的药品和违法所得。
四、建议与警示
- 严格遵守法律法规：医疗机构应确保所销售的药品来源合法、质量可靠，避免销售假药或劣药。
- 加强内部管理：建立健全药品采购、验收、储存、销售等环节的管理制度，确保药品质量可控。
- 及时应对法律风险：一旦发现销售了假药或劣药，应立即停止销售，主动配合相关部门的调查，并积极承担相应的法律责任。
医疗机构必须高度重视药品销售的法律风险，严格遵守相关法律法规，确保药品质量与安全。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。