在处理退房后的合同问题时，确实需要根据租赁关系的不同结束方式来采取相应的措施，以确保双方的权益得到妥善保护，并有效预防未来可能的法律纠纷。以下是我为您提供的详细解答：
一、合同正常履行完毕
双方确认与交接：
- 在退房前，您应确保房屋结构完整、设施设备无损坏，并已结清所有相关费用，如租金、水电费、物业费等。
- 与房东进行退房交接，双方对退房事宜无异议后，进行书面确认，这可以是退房交接单或其他形式的书面文件。
合同处理：
- 合同文本：双方可以选择当面销毁各自持有的合同文本，以示租赁关系终止。或者，在合同文本上显著注明“合同已履行完毕，租赁关系终止”字样，并由双方签字确认后留存备查。
- 附属文件：与租房合同相关的附属文件，如房屋交接清单、租金支付凭证等，也应按照类似原则处理和保存，以备未来可能的需要。
二、双方协商一致解除合同
合同解除：
- 根据《民法典》的相关规定，当事人协商一致可以解除合同。双方可以签署书面协议，明确解除合同的事由、双方权益以及解除后的相关事宜。
退房流程：
- 遵循清理房屋、通知房东、进行交接、书面确认的流程进行退房。确保房屋整洁、设施完好，并与房东进行详细的交接工作。
合同与证据保管：
- 合同解除后，双方仍应妥善保管合同原件及相关证据，如解除合同的书面协议、退房交接单等，以备未来可能出现的纠纷之需。
三、合同存在纠纷
保留合同原件：
- 若退房过程中存在押金退还争议、房屋损坏赔偿等问题，双方应保留合同原件作为重要证据。这是解决纠纷的基础和关键。
协商与调解：
- 首先尝试通过协商解决问题，双方可以就争议事项进行友好沟通，寻求共识。协商内容可以记录在合同文本空白处或由双方签署书面协议。
- 若协商不成，可考虑通过房屋中介、社区调解机构等第三方介入调解，以寻求更公正、合理的解决方案。
诉讼准备：
- 若进入诉讼程序，双方应妥善保管好合同原件及相关证据，如租金支付凭证、房屋损坏照片等，以便向法院举证证明自己的主张。
四、综合建议
- 积极沟通：无论何种情况，双方都应保持积极沟通，明确责任义务，避免误解和纠纷的发生。
- 书面记录：重要事项应形成书面记录，并由双方签字确认。这有助于确保双方权益得到有效保护，并在未来可能出现的纠纷中提供有力证据。
- 妥善保管：合同及相关文件应妥善保管，避免遗失或损坏。可以将其存放在安全的地方，如保险柜或文件夹中，以备不时之需。
综上所述，退房后合同的处理方式需根据具体情况灵活应对。但无论如何处理，都应确保双方权益得到保障，并有效预防未来可能的法律纠纷。希望这些建议能对您有所帮助。