高校收取的合同违约金是否需要上缴财政，需根据具体情况判断，主要取决于高校的性质以及违约金的来源和用途。以下是具体分析：

1. 公立高校
   公立高校属于事业单位，其资金管理需遵循《事业单位财务规则》及财政部门的相关规定。若违约金属于非税收入（如因学生违约退学、教职工违约离职等产生的费用），且符合当地财政部门对非税收入的管理要求，则通常需上缴财政，实行“收支两条线”管理。但若违约金用于弥补高校因违约行为产生的直接损失（如设备损坏、项目中断等），且财政部门允许留存使用，则可能无需上缴。

2. 私立高校
   私立高校的资金管理相对灵活，违约金通常作为高校自主收入，用于弥补损失或补充办学经费，无需上缴财政。但需注意，私立高校仍需遵守《民办教育促进法》等法规，确保资金使用的合法性和透明性。

3. 特殊情形

   • 科研合同违约金：若违约金涉及横向科研项目（如企业委托研发），通常按合同约定处理，高校可留存用于项目继续开展或弥补损失，无需上缴。
     
   • 政府采购合同违约金：若高校作为采购方违约，需按财政部门规定处理；若作为供应方被扣违约金，则需根据合同条款和财政要求决定是否上缴。

建议：高校应结合自身性质、违约金性质及当地财政规定，制定内部管理制度，明确违约金的收取、使用和上缴流程。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体合同条款和地方政策为您详细分析。