关于“只有总包才可以代发工资吗”这一问题，我们可以从法律层面和实际操作层面进行详细解析。

法律层面：

根据《保障农民工工资支付条例》的相关规定，在工程建设领域，确实推行了分包单位农民工工资委托施工总承包单位代发的制度。这一制度设计的主要目的是保障农民工的合法权益，确保工资能够及时、足额地发放到他们手中。具体来说，分包单位需要按月考核农民工的工作量，并编制工资支付表，经农民工本人签字确认后，交给施工总承包单位。施工总承包单位则根据这份工资支付表，通过农民工工资专用账户直接将工资支付到农民工本人的银行账户。

然而，这并不意味着只有总包单位才能代发工资。在一般的劳动关系中，用人单位（可能是总包单位，也可能是分包单位或其他任何形式的用工主体）都有义务直接向劳动者支付工资。只是在工程建设领域，为了更有效地保障农民工的工资权益，法律特别规定了总包单位的代发责任。

实际操作层面：

在实际操作中，总包单位代发工资确实具有诸多优势。首先，总包单位通常对工程资金有更强的掌控和调配能力，能够更好地确保工资的及时支付。其次，作为工程项目的核心管理者，总包单位对工程的进度、质量、人员等方面都有全面的了解和掌控，便于对分包单位的用工情况和工资发放情况进行监督和管理。最后，如果总包单位未能履行保障农民工工资支付的责任，可能会面临法律责任和声誉风险，这也促使总包单位更加重视工资发放工作。

但同样需要注意的是，这并不排除其他用工主体直接向劳动者支付工资的可能性。只要符合法律法规的规定，且能够确保工资的及时、足额支付，其他用工主体也可以承担工资发放的责任。

总结：

综上所述，虽然《保障农民工工资支付条例》在工程建设领域推行了总包单位代发农民工工资的制度，但这并不意味着只有总包单位才能代发工资。在一般的劳动关系中，用人单位都有义务直接向劳动者支付工资。只是在工程建设领域，为了更有效地保障农民工的工资权益，法律特别强调了总包单位的代发责任。因此，我们不能一概而论地说只有总包才可以代发工资。