针对您提出的“写了申请保留违建房的证明是否有效以及该怎么办”的问题，我将从法律程序、证明效力以及应对措施三个方面为您详细解答。

一、申请保留违建房的证明效力

首先，需要明确的是，违建房本身是不符合城乡规划或相关法律法规的建筑物，其存在本身就可能面临被拆除、罚款等法律后果。因此，单纯写一份申请保留违建房的证明，并不能直接改变违建房的法律性质，也不能保证违建房能够被合法保留。

证明的有效性取决于其内容是否真实、合法，以及是否能够得到相关部门的认可。如果证明中只是表达了您希望保留违建房的意愿，而没有提供任何合法依据或理由，那么这份证明很可能不会被相关部门采纳。

二、应对措施

1. 了解违建房的具体情况：

   • 您需要明确违建房的具体位置、面积、建设时间等信息。
   • 了解违建房是否占用了公共空间、基本农田或其他受法律保护的区域。
   • 确认违建房是否已经取得了相关的建设许可或审批手续（尽管可能是违法的，但了解这一点有助于后续处理）。

2. 咨询专业法律意见：

   • 建议您咨询专业的律师或法律机构，了解违建房的法律后果以及可能的处理方式。
   • 律师可以根据您的具体情况，提供个性化的法律建议和解决方案。

3. 与相关部门沟通：

   • 在了解违建房的具体情况和法律意见后，您可以尝试与当地的城乡规划部门、城管执法部门等相关机构进行沟通。
   • 说明您的实际情况和困难，询问是否有合法的途径可以保留违建房（如补办手续、缴纳罚款等）。
   • 如果沟通无果，您可以要求相关部门出具正式的书面答复，以便后续维权。

4. 考虑合法化途径：

   • 如果违建房符合城乡规划或相关法律法规的某些条件（如未占用公共空间、基本农田等），您可以尝试通过补办手续、缴纳罚款等方式使其合法化。
   • 但需要注意的是，合法化途径可能因地区而异，且需要满足一定的条件和程序。

5. 准备应对拆除等法律后果：

   • 如果违建房无法合法化，且面临被拆除的风险，您需要做好相应的准备。
   • 包括了解拆除程序、补偿标准等信息，以及准备必要的法律文件和证据以维护自己的合法权益。

三、总结与建议

写申请保留违建房的证明本身并不能直接改变违建房的法律性质。面对违建房问题，建议您首先了解违建房的具体情况，然后咨询专业法律意见，与相关部门进行沟通，并考虑合法化途径或准备应对拆除等法律后果。在整个过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。