核心结论：将商铺房产证借给别人注册公司，为保障自身权益，需签订一份详细、严谨且合法的借用合同，合同中应明确双方权利义务、违约责任等关键条款。以下是具体合同要点及示例条款说明：

合同要点

1. 明确双方信息：合同开头应清晰写明出借方（您）和借用方（对方）的姓名、身份证号、联系方式等基本信息，确保主体明确，避免后续因主体不清产生纠纷。
2. 借用目的与期限：详细说明借用房产证的具体目的，即用于注册公司，并明确借用期限，例如自某年某月某日起至某年某月某日止。期限约定要合理且明确，防止借用方无限期占用。
3. 双方权利义务
   • 出借方权利义务：您有权在借用期限内要求借用方妥善保管房产证，不得用于其他非法或未经您同意的用途；有义务在借用期限届满后，及时收回房产证。同时，可约定在借用期间，若因借用方原因导致房产证损坏或丢失，借用方应承担的赔偿责任。
   • 借用方权利义务：借用方有权在约定的借用期限内使用房产证用于公司注册相关事宜；有义务按照合同约定的用途使用房产证，不得转借他人或进行其他违法活动。借用方还应确保公司注册过程中遵守相关法律法规，若因公司注册问题给您造成损失，应承担赔偿责任。
4. 违约责任：明确双方违反合同约定时应承担的责任。例如，若借用方未按照约定用途使用房产证或逾期未归还，应支付一定数额的违约金；若因借用方的行为给您造成其他损失，借用方应全额赔偿。
5. 争议解决方式：约定双方在履行合同过程中发生争议时的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。一般建议选择诉讼方式，并明确管辖法院，通常可选择房产所在地或合同签订地的法院。
6. 合同生效与变更：说明合同的生效条件，如双方签字（或盖章）后生效。同时，约定合同的变更需经双方协商一致，并签订书面变更协议。

示例条款

商铺房产证借用合同

甲方（出借方）：[您的姓名]，身份证号：[您的身份证号码]，联系方式：[您的电话号码] 乙方（借用方）：[对方姓名]，身份证号：[对方身份证号码]，联系方式：[对方电话号码]

鉴于乙方需使用甲方商铺房产证用于公司注册事宜，经双方友好协商，达成如下协议：

一、借用目的与期限

1. 乙方借用甲方位于[商铺具体地址]的房产证，仅用于注册[公司名称]公司，不得用于其他任何用途。
2. 借用期限自[起始日期]起至[结束日期]止。借用期限届满，乙方应立即将房产证归还甲方。如需续借，双方应另行协商并签订书面协议。

二、双方权利义务

（一）甲方权利义务

1. 甲方有权监督乙方对房产证的使用情况，确保乙方按照合同约定用途使用。
2. 甲方应在借用期限届满后，及时收回房产证。
3. 若因乙方原因导致房产证损坏或丢失，甲方有权要求乙方按照房产证的实际价值进行赔偿。

（二）乙方权利义务

1. 乙方有权在借用期限内使用房产证用于公司注册相关事宜。
2. 乙方应妥善保管房产证，不得转借他人或进行其他违法活动。
3. 乙方应确保公司注册过程中遵守相关法律法规，若因公司注册问题给甲方造成损失，乙方应承担全部赔偿责任。

三、违约责任

1. 若乙方未按照约定用途使用房产证，甲方有权立即收回房产证，并要求乙方支付违约金[X]元。
2. 若乙方逾期未归还房产证，每逾期一日，应按照房产证价值的[X%]向甲方支付逾期违约金。逾期超过[X]日的，甲方有权解除本合同，并要求乙方承担因此给甲方造成的全部损失。
3. 若因乙方的行为给甲方造成其他损失，乙方应全额赔偿。

四、争议解决方式

本合同在履行过程中如发生争议，双方应首先友好协商解决；协商不成的，任何一方均有权向房产所在地有管辖权的人民法院提起诉讼。

五、合同生效与变更

1. 本合同自双方签字（或盖章）之日起生效。
2. 本合同的变更需经双方协商一致，并签订书面变更协议。

甲方（签字/盖章）：__________________ 日期：___年_月____日

乙方（签字/盖章）：__________________ 日期：___年_月____日

注意事项：签订合同前，建议您仔细审查合同条款，确保合同内容符合您的意愿和实际情况。如有必要，可咨询专业法律人士对合同进行审核。合同签订后，双方应严格按照合同约定履行各自义务，以避免不必要的法律纠纷。若在合同履行过程中遇到任何问题，欢迎随时向我咨询。