结论：承包公司将项目转包造成扣分，责任归属需根据具体情况判断，一般可能涉及承包公司、实际施工人以及可能存在的其他相关方。
分析：
承包公司的责任：
- 根据相关法律法规，承包公司未经发包人同意，擅自将工程转包给第三人的，属于违法行为。若因此导致工程出现质量问题、安全事故或违反相关管理规定而被扣分，承包公司作为违法转包方，通常需要承担主要责任。
- 承包公司作为与发包人签订合同的主体，有义务按照合同约定履行工程任务，确保工程质量。转包行为本身就违反了合同约定和法律规定，因此承包公司应当对转包行为导致的后果负责。
实际施工人的责任：
- 实际施工人作为工程的直接实施者，对工程质量、安全等方面负有直接责任。如果扣分是由于实际施工人的过错导致的，如施工质量不达标、违反安全规定等，那么实际施工人也需要承担相应的责任。
- 然而，在实际操作中，由于实际施工人往往与承包公司之间存在复杂的法律关系，且实际施工人可能并不具备相应的资质和条件，因此其责任承担可能会受到一定限制。但无论如何，实际施工人的过错行为都是导致扣分的重要因素之一。
其他相关方的责任：
- 在某些情况下，扣分可能还涉及其他相关方，如监理单位、设计单位等。如果这些单位在工程实施过程中存在过错或疏忽，导致工程出现问题而被扣分，那么它们也需要承担相应的责任。
- 但就承包公司转包这一行为本身而言，其他相关方的责任通常不是主要的，除非它们与转包行为存在直接的关联或过错。
法律建议：
- 对于承包公司而言，应严格遵守法律法规和合同约定，不得擅自转包工程。如果确实需要转包部分工程，应事先征得发包人的同意，并确保转包给具备相应资质和条件的单位。
- 对于实际施工人而言，应确保自身具备相应的资质和条件，并严格按照合同约定和施工规范进行施工。如果发现承包公司存在违法转包行为，应及时向相关部门举报。
- 如果因转包行为导致扣分或其他法律后果，各方应积极协商解决，必要时可寻求法律途径维护自身权益。
可能后果：
- 如果承包公司因转包行为被扣分或受到其他处罚，可能会影响其企业信誉和资质等级，进而影响其未来的业务承接和发展。
- 实际施工人如果因过错行为导致扣分或承担法律责任，可能会面临经济赔偿、行政处罚甚至刑事责任等后果。
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