两份特困人员抚养协议的效力大小，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
协议签订时间：一般来说，后签订的协议如果明确表示对前协议的修改或替代，且符合法律规定的形式和实质要件，那么后协议的效力可能会大于前协议。但如果后协议并未明确表示替代前协议，或者存在其他影响效力的因素（如欺诈、胁迫等），则不能简单地认为后协议效力更大。
协议内容合法性及完整性：如果一份协议的内容完全符合法律法规的规定，且条款完整、明确，没有歧义或遗漏，而另一份协议则存在违法条款或内容模糊、不完整的情况，那么合法且完整的协议效力通常会更大。因为合法有效的协议是受到法律保护的，而违法或存在瑕疵的协议则可能被认定为无效或部分无效。
协议签订主体的意愿及行为能力：如果两份协议的签订主体（如特困人员及其亲属、抚养人等）在签订协议时均具备完全民事行为能力，且是出于真实意愿签订的协议，那么两份协议的效力应当是平等的。但如果其中一份协议的签订主体存在行为能力受限（如未成年人、精神病人等）或受到欺诈、胁迫等情况，那么该协议的效力可能会受到影响。
协议履行情况：如果其中一份协议已经得到了实际履行，且履行过程中没有出现争议或纠纷，而另一份协议则尚未履行或履行过程中出现了问题，那么在实际履行的协议在某种程度上可能会被视为具有更大的效力。但这并不是绝对的，因为协议的效力最终还是要取决于其本身的合法性和有效性。