行政单位旷工扣工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若单位规章制度合法且旷工事实成立：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关劳动法规，用人单位有权根据依法制定的规章制度对员工进行管理。若行政单位的规章制度中明确规定了旷工的处罚措施，包括扣减工资，且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知劳动者，同时不违反法律、行政法规及政策规定，那么该规章制度是合法的。
   • 在此情况下，如果员工确实存在旷工行为，行政单位依据合法有效的规章制度扣减旷工期间的工资，是合法的行为。

2. 若单位规章制度不合法或旷工事实不成立：

   • 如果行政单位的规章制度未经过民主程序制定、未公示或告知劳动者，或者规章制度的内容违反法律、行政法规及政策规定，那么该规章制度是不合法的。在此情况下，行政单位依据不合法的规章制度扣减员工工资，是违法的行为。
   • 另外，如果员工并未旷工，或者旷工的事实不成立（例如，员工有合理的请假手续或因不可抗力原因未能出勤），那么行政单位扣减员工工资也是违法的。

法律建议：

• 对于行政单位而言，应确保规章制度的合法性和有效性，包括经过民主程序制定、公示或告知劳动者，以及不违反法律、行政法规及政策规定。同时，在处理旷工等违纪行为时，应确保事实清楚、证据确凿，并依据合法有效的规章制度进行处罚。
• 对于员工而言，如果认为行政单位扣减工资的行为违法，可以首先与单位进行沟通协商，要求单位提供扣减工资的合法依据。如果沟通协商无果，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果行政单位违法扣减员工工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、补发工资、支付赔偿金等。
• 同时，违法扣减工资的行为也可能影响单位的声誉和员工的工作积极性，对单位的长期发展产生不利影响。

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