在有资质的伤残鉴定机构做的伤残鉴定，保险公司大多数情况下会认可，但并非绝对，具体需结合以下因素判断：

1. 鉴定机构资质的合法性
   若伤残鉴定机构具备司法行政机关颁发的合法资质（如《司法鉴定许可证》），且鉴定范围包含“法医临床鉴定”等与伤残等级评定相关的项目，其出具的鉴定结论通常具有法律效力，保险公司一般无权直接否定。但需注意：

   • 资质需在有效期内，且未被行政机关暂停或撤销；
     
   • 鉴定机构需与案件无利害关系（如非保险公司指定或关联机构）。

2. 鉴定程序与标准的合规性
   保险公司可能对以下程序问题提出异议：

   • 鉴定时机：需在伤情稳定后进行（如医疗终结期满），过早鉴定可能导致结论被推翻；
     
   • 鉴定依据：需采用《人体损伤致残程度分级》等现行有效标准，若引用废止标准（如旧版《道路交通事故受伤人员伤残评定》）可能被拒；
     
   • 参与人员：需由2名以上具有执业资格的鉴定人共同完成，且专业领域与伤情匹配（如骨科医生评定肢体伤残）。

3. 保险公司对鉴定结论的审查权
   即使鉴定机构合法，保险公司仍可能通过以下方式挑战结论：

   • 申请重新鉴定：若保险公司有证据证明鉴定程序违法、结论明显依据不足（如未考虑关键病历资料），可向法院申请重新鉴定；
     
   • 协商处理：部分保险公司会与被保险人协商，委托双方共同认可的机构重新鉴定，以避免诉讼成本。

4. 司法实践中的倾向性
   法院对合法鉴定结论的采信率较高，但若保险公司提出合理异议（如鉴定人未出庭接受质询、鉴定材料不完整），法院可能要求补充说明或启动重新鉴定。因此，鉴定结论的“可诉性”是保险公司是否认可的关键。

建议：

• 委托鉴定前，要求机构出示资质证书并核对鉴定范围；
  
• 保留完整医疗记录（如病历、检查报告）作为鉴定依据；
  
• 若保险公司拒赔，可要求其出具书面异议理由，必要时通过诉讼解决。
  

如有具体案件细节（如伤情类型、保险条款等），可进一步向我咨询，我会结合实务经验为您分析。