结论：个体经营店每天工作九个半小时，60元一天的工资是否合法，需结合具体情况判断，但从常规情况来看，这种工资支付方式很可能不合法。以下从不同角度进行分析：
一、从工作时间角度分析
根据《劳动法》的相关规定，劳动者每日工作时间一般不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果个体经营店要求员工每天工作9个半小时，这明显超过了法定的工作时间上限。除非存在特殊情况，如因生产经营需要，且与工会和劳动者协商一致，并依法支付加班费，否则这种超时工作是不合法的。
二、从工资支付角度分析
最低工资标准：
- 各地都设有最低工资标准，这是劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位应支付的最低劳动报酬。
- 如果60元一天的工资低于当地最低工资标准（按日计算或按月折算后），那么这种工资支付方式是不合法的。
加班费支付：
- 如果员工每天工作9个半小时，其中超出的1个半小时应视为加班时间。
- 根据《劳动法》的规定，加班应支付加班费，且加班费的支付标准应高于正常工作时间的工资。
- 如果个体经营店未支付加班费，或者支付的加班费低于法定标准，那么这种工资支付方式也是不合法的。
三、具体计算与判断
- 假设当地最低工资标准为每月2000元（此数值为假设，实际应查询当地具体标准），按月工作22天计算，每日最低工资应为\(2000{\div} 22\approx90.91\)元。
- 如果个体经营店每天只支付60元，显然低于每日最低工资标准，因此不合法。
- 即使考虑加班费，如果超出的1个半小时未按照法定标准支付加班费，或者整体工资水平仍然低于最低工资标准（包括加班费在内），那么这种工资支付方式同样不合法。
四、建议与后果
建议：
- 如果你作为员工在这种个体经营店工作，且认为工资支付方式不合法，建议先与雇主进行沟通协商，要求按照法定标准支付工资和加班费。
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
后果：
- 如果个体经营店被查实存在违法支付工资的行为，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
- 同时，作为员工，你也有权要求雇主补发工资差额和加班费，并可能获得相应的经济补偿。
综上所述，个体经营店每天工作九个半小时，60元一天的工资支付方式在大多数情况下是不合法的。如果你面临这种情况，建议及时采取措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。