在销售有毒有害食品案中，若检察机关作出不予起诉决定后，行政机关仍可依法对涉案主体进行行政处罚。以下从法律背景、行政处罚的种类与依据、以及可能的法律后果等角度进行详细分析：

法律背景

1. 刑事与行政责任的独立性：在食品安全领域，刑事责任与行政责任是相互独立的。即使检察机关因证据不足、情节轻微等原因作出不予起诉决定，这并不意味着涉案主体无需承担行政责任。行政机关仍可根据相关法律法规，对涉案主体进行行政处罚。

2. 《食品安全法》的相关规定：根据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定，对于销售有毒有害食品的行为，行政机关有权依法进行处罚，包括但不限于罚款、没收违法所得、吊销许可证等。

行政处罚的种类与依据

1. 罚款：根据《食品安全法》第一百二十三条，对于销售明知是不符合食品安全标准的食品，且情节严重的，行政机关可以处以货值金额十五倍以上三十倍以下的罚款；情节特别严重的，吊销许可证，并可以由公安机关对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处五日以上十五日以下拘留。即使检察机关不予起诉，行政机关仍可根据此条款进行罚款。

2. 没收违法所得：行政机关有权没收涉案主体因销售有毒有害食品所获得的违法所得，以消除其非法利益。

3. 吊销许可证：对于情节严重的销售有毒有害食品行为，行政机关可以吊销涉案主体的食品生产经营许可证，禁止其继续从事相关经营活动。

4. 其他行政处罚：根据具体情况，行政机关还可以采取责令停产停业、警告等其他行政处罚措施。

可能的法律后果

1. 行政处罚的严厉性：与刑事责任相比，行政处罚虽然不涉及人身自由，但其严厉性不容忽视。特别是罚款和吊销许可证等处罚措施，可能对涉案主体的经济利益和商业信誉造成重大影响。

2. 信用记录受损：行政处罚决定通常会被记录在涉案主体的信用记录中，对其未来的商业活动产生负面影响。例如，其他企业在选择合作伙伴时，可能会因涉案主体的不良信用记录而拒绝合作。

3. 社会舆论压力：销售有毒有害食品的行为往往会引起社会广泛关注，涉案主体可能面临来自公众和媒体的舆论压力。这种压力可能进一步损害其商业信誉和品牌形象。

建议与措施

1. 积极配合行政机关调查：在检察机关不予起诉后，涉案主体应积极配合行政机关的调查工作，如实提供相关证据和信息，以争取从轻或减轻行政处罚。

2. 加强内部管理：涉案主体应加强内部管理，完善食品安全管理制度和操作规程，确保类似事件不再发生。

3. 寻求法律帮助：如有需要，涉案主体可以寻求专业律师的法律帮助，以更好地应对行政处罚和可能的法律纠纷。

总结来说，销售有毒有害食品案不予起诉后，行政机关仍可依法对涉案主体进行行政处罚。涉案主体应积极配合调查、加强内部管理，并在必要时寻求法律帮助，以应对可能的法律后果。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。