商家在结账时反向抹零属于违法行为，消费者有权要求商家进行赔偿，具体赔偿方式需根据实际情况确定。以下从不同角度进行分析：

一、反向抹零行为的法律定性

根据《中华人民共和国价格法》第十三条第二款规定，经营者不得在标价之外加价出售商品，不得收取任何未予标明的费用。反向抹零行为，即商家在结账时，未经消费者同意，擅自将消费金额向上取整，多收取消费者部分费用，实质上属于“在标价之外加价出售商品或者提供服务”的违法行为。

二、消费者的权利与商家的义务

1. 消费者的知情权与选择权：消费者在购买商品或接受服务时，有权了解商品或服务的真实价格，并有权选择是否接受该价格。商家反向抹零的行为，侵犯了消费者的知情权和选择权。
2. 商家的明码标价义务：商家有义务对商品或服务进行明码标价，确保消费者在购买前能够了解商品或服务的真实价格。商家不得在标价之外加价出售商品或提供服务，也不得收取任何未予标明的费用。

三、赔偿方式与依据

1. 退还多收款项：商家应退还消费者因反向抹零行为而多支付的款项。这是商家最基本的法律义务，也是消费者最直接的赔偿方式。
2. 赔偿损失：如果商家反向抹零行为给消费者造成了其他损失（如因多支付款项而产生的利息损失、交通费用等），商家还应承担相应的赔偿责任。但需要注意的是，消费者需提供证据证明其实际损失的存在及金额。
3. 行政处罚：根据《价格违法行为行政处罚规定》第十三条，经营者违反明码标价规定，在标价之外加价出售商品或者收取未标明的费用的，责令改正，没收违法所得，可以并处5000元以下的罚款。因此，消费者还可以向市场监管部门投诉商家的反向抹零行为，由市场监管部门对商家进行行政处罚。

四、实际操作建议

1. 保留证据：消费者在遇到反向抹零行为时，应保留好购物小票、发票等证据，以便在后续维权过程中证明商家的违法行为及自己的实际损失。
2. 与商家协商：消费者可以先尝试与商家协商解决，要求商家退还多收款项并赔偿损失。如果商家拒绝协商或协商无果，消费者可以向市场监管部门投诉或寻求法律援助。
3. 寻求法律援助：如果消费者的损失较大或商家态度恶劣，消费者可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。