当劳务合同被法院认定为建工分包工程款时，工程款的计算需结合具体案情、合同约定及法律规定综合判定，以下是具体分析：

1. 合同约定优先原则
   若劳务合同中明确约定了工程款计算方式（如固定单价、工程量清单计价等），且该约定不违反法律强制性规定，法院通常会优先按合同约定计算。例如：合同约定按实际完成工程量乘以单价结算，则需根据双方确认的工程量及约定单价核算。

2. 实际履行情况补充
   若合同未明确约定或约定不明，法院会结合实际履行情况确定计算方式：

   • 工程量认定：通过施工图纸、签证单、验收记录等证据确定实际完成工程量；
     
   • 计价标准：参照行业惯例、市场价或政府指导价（如定额标准）确定单价；
     
   • 变更与索赔：若存在设计变更、工期延误等情形，需根据合同约定或实际损失调整工程款。

3. 法律强制性规定兜底
   若合同因违法分包（如无资质分包、超越资质等级分包）被认定无效，但工程经竣工验收合格，法院可能参照合同约定折价补偿。此时需注意：

   • 折价比例：根据过错程度、实际投入等因素综合判定；
     
   • 利润扣除：违法分包情形下，分包人可能无法主张合同约定的利润部分。

4. 举证责任分配
   主张工程款的一方需承担举证责任，需提供：

   • 合同文本、补充协议等证明权利义务关系；
     
   • 施工记录、验收报告等证明实际履行情况；
     
   • 结算单、付款凭证等证明已付款及欠款金额。

建议：若涉及此类纠纷，需立即整理合同、施工记录、结算文件等证据，并委托专业律师分析合同效力、工程量及计价依据，以制定诉讼策略。如有具体案情或证据材料，可直接向我咨询进一步分析。