离职工资表与公司制度不符的工作交接表，并不能直接证明员工已经自动离职。以下从几个方面进行详细分析：

一、离职的证明标准

在法律上，离职通常需要明确的离职申请、离职通知或者双方协商一致的离职协议等文件来证明。这些文件应当明确表达员工离职的意愿，并且通常需要得到公司的确认或接受。仅仅因为离职工资表与公司制度不符的工作交接表存在，并不能直接推断出员工已经自动离职。

二、工作交接表与离职的关系

工作交接表通常是员工在离职前需要完成的一项工作，用于确保工作的顺利交接和避免因离职而给公司带来不必要的损失。然而，工作交接表本身并不包含离职的明确意愿或声明，它只是离职流程中的一个环节。因此，即使工作交接表与公司制度不符，也不能直接作为离职的证明。

三、离职工资表的性质

离职工资表是记录员工离职时工资结算情况的表格，它反映了员工在离职时的工资待遇和结算情况。然而，离职工资表同样不包含离职的明确意愿或声明，它只是对员工离职时工资待遇的一种记录。因此，离职工资表也不能直接证明员工已经自动离职。

四、可能的法律后果与建议

1. 如果员工确实已经离职：

   • 员工应当与公司办理正式的离职手续，包括提交离职申请、完成工作交接、结算工资等。
   • 公司应当为员工出具离职证明，并办理相关社保、公积金等手续的转移。

2. 如果员工并未离职：

   • 员工应当与公司沟通，明确自己的工作状态和离职意愿（如果有的话）。
   • 如果公司存在违法行为（如拖欠工资、未办理社保等），员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

3. 对于公司制度不符的工作交接表：

   • 员工可以与公司沟通，了解公司制度的具体要求，并尝试按照公司制度的要求进行工作交接。
   • 如果公司制度存在不合理之处，员工也可以提出自己的意见和建议，与公司协商解决。

总结来说，离职工资表与公司制度不符的工作交接表并不能直接证明员工已经自动离职。在处理此类问题时，建议员工与公司进行充分沟通，明确各自的权利和义务，并按照法律程序办理离职手续。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。