结论：同事偷偷拍摄你迟到的视频是否违法，需根据拍摄的具体情况、视频的使用目的及传播范围等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、拍摄行为本身是否违法
隐私权角度：
- 若拍摄行为发生在公共场所（如公司走廊、电梯间等），且拍摄内容不涉及你的私密信息或身体隐私部位，一般不构成侵犯隐私权。因为公共场所的行为，通常被视为自愿暴露于公众视野之下。
- 若拍摄行为发生在非公共场所（如你的私人办公室、更衣室等），且未经你同意，则可能侵犯你的隐私权。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人享有隐私权，任何组织或者个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。
肖像权角度：
- 无论拍摄场所是公共还是非公共，若同事未经你同意，擅自拍摄你的肖像并用于商业用途或恶意传播，可能构成侵犯肖像权。根据《中华人民共和国民法典》的规定，自然人享有肖像权，未经肖像权人同意，不得制作、使用、公开肖像权人的肖像。
二、视频的使用目的及传播范围
内部使用：
- 若同事拍摄的视频仅在公司内部使用，如用于考勤管理、内部纪律处分等，且未公开传播或恶意使用，一般不构成违法。但公司应确保拍摄行为的合法性和正当性，避免侵犯员工的合法权益。
公开传播或恶意使用：
- 若同事将拍摄的视频公开传播到社交媒体、网络论坛等平台，或用于恶意诽谤、侮辱等目的，则可能构成侵犯你的名誉权、隐私权或肖像权。根据相关法律法规，你有权要求侵权人停止侵害、消除影响、恢复名誉、赔礼道歉，并可以要求赔偿损失。
三、法律建议
与同事沟通：
- 首先，你可以尝试与同事进行沟通，了解其拍摄视频的目的和意图，并表达你的不满和担忧。如果同事是出于无意或误解而拍摄，通过沟通可能能够解决问题。
向公司反映：
- 如果沟通无果，你可以向公司的人力资源部门或相关管理部门反映情况，要求公司介入处理。公司应制定相应的规章制度，规范员工的拍摄行为，保护员工的合法权益。
寻求法律帮助：
- 如果同事的行为已经构成侵权，且公司无法有效解决问题，你可以考虑寻求法律帮助。你可以咨询专业律师（比如我），了解你的权益和维权途径，并根据具体情况提起民事诉讼或采取其他法律措施。
进一步思考：在处理此类问题时，除了考虑法律因素外，还应考虑人际关系和职场氛围。在维护自己合法权益的同时，也应尽量保持冷静和理性，避免过度反应或激化矛盾。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。