骗取医疗补助金2.5万元，单位确实可能会追究相关责任。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律责任角度
刑事责任：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诈骗公私财物，数额较大的，构成诈骗罪。骗取医疗补助金，若数额达到刑事立案标准（一般而言，诈骗公私财物价值三千元至一万元以上即构成数额较大，具体标准可能因地区而异），则可能面临刑事追究，包括有期徒刑、拘役或管制，并处或单处罚金。
- 在本案例中，骗取2.5万元医疗补助金，已明显超过多数地区的刑事立案标准，因此存在被追究刑事责任的风险。
行政责任：
- 即使骗取金额未达到刑事立案标准，也可能面临行政处罚。根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，诈骗公私财物的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款。
民事责任：
- 骗取医疗补助金还可能涉及民事赔偿责任。如果因骗取行为给单位或他人造成损失，骗取者需承担赔偿责任。
二、单位追究角度
内部纪律处分：
- 单位作为医疗补助金的发放主体，有权对骗取行为进行内部调查，并根据调查结果对涉事员工进行纪律处分，如警告、记过、降职、解雇等。
要求返还补助金：
- 单位有权要求骗取者返还已领取的医疗补助金，并可能要求支付因此产生的额外费用，如调查费用、律师费用等。
报案处理：
- 如果单位认为骗取行为涉嫌犯罪，有权向公安机关报案，由公安机关依法进行侦查和处理。
三、建议与后果
主动退还并承认错误：
- 如果已经骗取了医疗补助金，建议尽快主动退还，并向单位承认错误，争取从轻处理。主动退还和承认错误可能有助于减轻或避免刑事责任、行政责任和民事责任。
面临法律后果：
- 如果拒不退还或继续隐瞒骗取行为，将面临更严重的法律后果，包括刑事追究、行政处罚和民事赔偿等。
影响个人信用和职业前景：
- 骗取行为一旦被发现，将对个人信用造成严重影响，可能影响未来的就业、贷款等。同时，也可能对职业前景产生负面影响，如被行业禁入、失去职业资格等。
综上所述，骗取医疗补助金2.5万元是严重的违法行为，单位确实可能会追究相关责任。建议尽快主动退还并承认错误，以减轻或避免法律后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。