结论：员工31号入职，工资每月几号发放是否合法，需根据劳动合同中的具体约定以及当地的劳动法规来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
劳动合同约定：
- 如果用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定了工资支付日期，并且这一日期不违反法律法规的强制性规定，那么按照这一时间支付工资是合法的。例如，如果合同约定每月5号发放上月工资，且这一约定不违反当地规定，那么就是合法的。
- 特殊情况：对于员工31号入职的情况，如果合同约定的是“次月31号发上个月工资”，需考虑该约定是否合理且不违反当地规定。由于并非每个月都有31号，用人单位应与劳动者明确在没有31号的月份如何支付工资，如提前至该月最后一个工作日支付。
法律法规要求：
- 根据《工资支付暂行规定》，工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付，且至少每月支付一次。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。这表明，工资的支付时间和周期是有明确规定的，但具体日期可由双方约定。
- 地区性规定：部分地区可能会出台更具体的工资支付规定，对支付时间有更严格的要求。例如，某些地方可能规定工资支付周期最长不得超过一个月，并明确了具体的支付期限。在这种情况下，如果劳动合同中的约定违反了这些规定，那么这种约定就是不合法的。
实际支付情况：
- 即使劳动合同中有明确的约定，但如果用人单位没有按照约定时间支付工资，存在无故拖欠的情况，这就违反了《劳动法》的相关规定，是不合法的。劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。
建议：
- 对于劳动者而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同中关于工资支付的条款，确保自己的权益得到保障。如果合同中的约定存在模糊或不合理之处，应及时与用人单位沟通并协商修改。
- 对于用人单位而言，应遵守当地的劳动法规，合理约定工资支付日期，并确保按时足额支付劳动者的工资。如果因特殊原因无法按时支付工资，应及时与劳动者沟通并说明情况，避免产生不必要的劳动纠纷。
示例：
假设某劳动者于31号入职某公司，双方在劳动合同中约定每月10号发放上月工资。这一约定不违反法律法规的强制性规定，且符合《工资支付暂行规定》中关于工资支付周期的要求。因此，该约定是合法的。如果公司未能按照约定时间支付工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
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