虚开发票中开票员的责任需根据其主观明知程度及行为性质综合判定，可能承担行政责任或刑事责任，具体处理方式如下：

1. 行政责任层面
   若开票员未直接参与虚开发票的策划或利益分配，但因疏忽或未尽审核义务导致虚开，可能被税务机关认定为“直接负责的主管人员或其他直接责任人员”。根据《税收征收管理法》第六十四条，税务机关可责令改正，并处以罚款（通常为虚开发票金额0.5倍至5倍的罚款）。若开票员属于企业员工，企业可能同时被追缴税款、滞纳金，并面临罚款。

2. 刑事责任层面
   若开票员明知他人虚开发票仍提供帮助（如伪造交易记录、协助资金回流等），可能构成共同犯罪。根据《刑法》第二百零五条：

   • 虚开增值税专用发票罪：若虚开税款数额较大（10万元以上）或造成国家税款损失5万元以上，可处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
     
   • 虚开发票罪（针对普通发票）：若虚开金额较大（40万元以上）或虚开发票100份以上，可处二年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金；情节严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
     关键点：刑事责任需以“主观明知”为前提，若开票员能证明自己仅按指令操作且不知情，可能免于刑事处罚，但仍需承担行政责任。

3. 责任减轻或免除的情形

   • 不知情抗辩：若开票员能提供证据（如书面指令、上级承诺合法性等）证明自己无主观故意，可能仅承担行政责任。
     
   • 从犯认定：若开票员在共同犯罪中起次要或辅助作用（如仅负责开票环节），可从轻、减轻处罚或免除处罚。
     
   • 自首或立功：主动投案并如实供述、协助抓捕其他犯罪嫌疑人等，可依法从宽处理。

建议：若您或相关人员涉及此类问题，需立即整理开票记录、沟通记录等证据，并从“主观明知程度”“行为参与度”“是否获利”等角度评估责任风险。具体应对策略需结合案件细节制定，您可直接向我咨询进一步分析。