结论：公司章程中规定“三个股东，少数服从多数”，而另两人占50%股份的情况下，表决是否有效，需结合具体表决事项、公司章程的具体规定以及相关法律法规来综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 表决事项的性质：

   • 一般事项：对于公司的一般经营决策事项，如果公司章程没有特别规定，通常遵循“资本多数决”原则，即按照股东的出资比例行使表决权。在此情况下，如果两个股东合计持有50%的股份，他们无法单独形成有效决议（除非公司章程另有规定或得到其他股东的同意），因为通常需要超过半数的表决权才能通过决议。但若公司章程规定“少数服从多数”且未明确具体比例，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么在实际操作中，可能会倾向于理解为按照股东人数多数决，但这种理解存在法律风险，因为资本多数决是公司法的基本原则。
   • 特别事项：对于公司章程修改、增减资、合并分立等特别事项，根据《公司法》的规定，通常需要代表三分之二以上表决权的股东通过。在此情况下，即使两个股东合计持有50%的股份，也无法单独通过此类特别决议。

2. 公司章程的具体规定：

   • 如果公司章程明确规定了“少数服从多数”的具体实施方式，比如明确是按照股东人数多数决还是按照表决权多数决，以及具体的表决比例要求，那么应当遵循公司章程的规定。
   • 如果公司章程的规定与法律法规的强制性规定相冲突，那么该规定将被视为无效，应依据法律法规的规定来执行。

3. 相关法律法规的考量：

   • 根据《公司法》的相关规定，股东会会议由股东按照出资比例行使表决权；但是，公司章程另有规定的除外。这意味着，公司章程可以在不违反法律法规强制性规定的前提下，对表决权行使方式作出特别规定。
   • 同时，要注意保护小股东的合法权益，避免大股东滥用表决权损害小股东的利益。如果表决方式或结果显失公平，可能引发法律纠纷。

建议：

• 对于公司而言，应在制定公司章程时明确表决权行使方式、表决比例要求等关键条款，以避免后续纠纷。
• 对于股东而言，应仔细阅读公司章程，了解自己的权利和义务，积极参与公司治理，维护自己的合法权益。
• 如果在实际操作中遇到表决纠纷，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。

可能后果：

• 如果表决方式或结果违反公司章程或法律法规的规定，可能导致决议无效或被撤销，进而影响公司的正常运营和股东的合法权益。
• 因此，在进行表决时，务必确保表决方式合法合规，表决结果真实有效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。