关于三人股东公司中，由两个股东以个人名义召集并通知的股东会是否有效的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要结合具体情况来分析。以下是我从不同角度给出的详细解答：

1. 股东会召集程序的合法性：

   • 根据《公司法》及相关规定，股东会的召集通常应遵循公司章程或法律规定的程序。这通常包括由特定主体（如董事会、执行董事、监事会或特定比例的股东）提出召集，并通过正式渠道（如书面通知）向所有股东发出召集通知。
   • 如果两个股东以个人名义召集股东会，但并未遵循公司章程或法律规定的程序，比如未经董事会或执行董事同意，或者未通过正式渠道向所有股东发出通知，那么这样的召集程序可能是不合法的。

2. 股东会通知的有效性：

   • 股东会通知的有效性取决于其是否及时、准确地传达给了所有股东。如果两个股东以个人名义发出的通知未能确保所有股东都收到，或者通知内容不完整、不准确，那么这样的通知可能是无效的。
   • 此外，即使通知被所有股东收到，但如果通知的召集程序本身不合法（如未经适当授权），那么基于该通知召开的股东会也可能被视为无效。

3. 股东会决议的效力：

   • 股东会决议的效力取决于股东会的召集程序、通知的有效性以及决议内容是否符合公司章程和法律规定。如果股东会的召集程序或通知存在瑕疵，那么基于该股东会作出的决议可能面临被撤销或确认无效的风险。
   • 在三人股东公司中，如果两个股东以个人名义召集并通知的股东会实际上得到了所有股东的参与（尽管程序上可能存在瑕疵），且决议内容未违反公司章程或法律规定，那么该决议在某些情况下可能仍然被视为有效。但这并非绝对，因为程序瑕疵可能仍然构成撤销决议的理由。

4. 实际操作中的建议：

   • 为了避免潜在的法律风险，建议股东在召集股东会时严格遵循公司章程和法律规定的程序。这包括由适当主体提出召集、通过正式渠道发出通知，并确保通知内容完整、准确。
   • 如果股东对股东会的召集程序或通知存在疑问，应及时向公司管理层或法律顾问咨询，以确保股东会的合法性和有效性。

总结来说，三人股东公司中由两个股东以个人名义召集并通知的股东会是否有效，取决于召集程序的合法性、通知的有效性以及决议内容是否符合公司章程和法律规定。为了避免潜在的法律风险，建议股东在召集股东会时严格遵守相关程序和规定。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。