作为被告，在庭审过程中发现提交的证据存在瑕疵，是可以当庭申请撤回的。不过，这一行为涉及多个法律层面和实际操作中的考量，下面我将从几个角度为你详细分析：

1. 撤回证据的法律依据：

   • 在民事诉讼中，当事人有权在法庭上提出证据，也有权在法庭辩论终结前撤回已经提出的证据。这是基于当事人诉讼权利的自主处分原则。但需要注意的是，撤回证据并不意味着该证据完全失效，如果对方同意或者法庭认为有必要，该证据仍可能被采纳。

2. 撤回证据的实际操作：

   • 当你发现证据存在瑕疵时，应立即向法庭提出撤回申请，并说明撤回的理由。法庭会根据案件的具体情况，决定是否允许你撤回证据。如果法庭允许，该证据将不再作为认定案件事实的依据。
   • 但需特别注意的是：如果瑕疵证据已经被对方质证，或者法庭已经基于该证据进行了部分或全部的审理，那么撤回的难度会相对较大。因为此时该证据可能已经对案件的审理产生了影响，法庭需要综合考虑撤回对案件公正审理的影响。

3. 撤回证据的法律后果：

   • 撤回证据后，你将失去该证据作为支持你主张的依据。如果该证据是关键证据，撤回可能会导致你的主张缺乏有力支持，从而影响案件的判决结果。
   • 另外，如果撤回证据的行为被法庭认为是不当行为（如故意提交瑕疵证据以干扰诉讼进程），法庭可能会对你进行相应的制裁，如警告、罚款等。

4. 建议与策略：

   • 在提交证据前，务必对证据进行仔细审查，确保其真实性、合法性和关联性，避免提交瑕疵证据。
   • 如果发现证据存在瑕疵，且该瑕疵可能影响案件的判决结果，建议及时与法庭沟通，说明情况，并考虑是否撤回该证据。同时，应积极准备其他证据以支持你的主张。
   • 在庭审过程中，保持冷静和理性，遵循法庭的程序和规则，避免因情绪化或不当行为而影响案件的审理。

总结来说，作为被告，在庭审过程中发现提交的证据存在瑕疵时，是可以当庭申请撤回的。但这一行为需要谨慎考虑，并遵循法庭的程序和规则。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。