结论前置：
- 挂靠资质施工合同无效时，实际施工人能否依据仲裁条款申请仲裁，关键在于仲裁条款本身的效力及独立性。若仲裁条款有效且独立存在，实际施工人可以依据该条款申请仲裁。
- 但需注意，若挂靠行为本身违法，且仲裁条款被认定为无效或不可执行，则实际施工人可能无法直接依据仲裁条款申请仲裁。
详细分析：
一、仲裁条款的效力与独立性
- 仲裁条款的效力：根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，仲裁条款是双方当事人自愿将争议提交仲裁解决的书面协议。只要仲裁条款符合法定形式要件（如明确约定仲裁机构、仲裁事项等），且不存在法定无效情形（如无民事行为能力人订立的、一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议的等），则仲裁条款有效。
- 仲裁条款的独立性：仲裁条款具有独立性，即合同中的仲裁条款独立于合同其他条款存在。即使合同整体无效，仲裁条款仍可能保持有效，除非仲裁条款本身存在无效情形。
二、挂靠资质施工合同无效的情形
- 挂靠行为违法：根据相关法律法规，没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义签订施工合同（即挂靠行为）是违法的，所签合同无效。
- 合同无效不影响仲裁条款效力：如前所述，仲裁条款具有独立性。因此，即使挂靠资质施工合同因违法而无效，合同中的仲裁条款仍可能保持有效，除非该仲裁条款本身存在无效情形。
三、实际施工人能否依据仲裁条款申请仲裁
- 仲裁条款有效且独立存在：若仲裁条款本身有效，且独立于无效的施工合同存在，则实际施工人可以依据该仲裁条款向约定的仲裁机构申请仲裁。
- 仲裁条款无效或不可执行：若仲裁条款因存在法定无效情形（如未明确约定仲裁机构、仲裁事项超出法律允许范围等）或因挂靠行为违法而被认定为无效或不可执行，则实际施工人无法直接依据该仲裁条款申请仲裁。此时，实际施工人可能需要通过诉讼等其他方式解决争议。
四、法律建议
- 审查仲裁条款：实际施工人在签订挂靠资质施工合同时，应仔细审查合同中的仲裁条款，确保其符合法定形式要件且不存在无效情形。
- 咨询专业律师：若对仲裁条款的效力或可执行性存在疑问，建议咨询专业律师以获取法律意见。
- 考虑其他纠纷解决方式：若仲裁条款无效或不可执行，实际施工人应考虑通过诉讼等其他方式解决争议，并提前准备相关证据和材料。
五、可能法律后果
- 若仲裁条款有效：实际施工人可以依据仲裁条款申请仲裁，仲裁机构将依法对争议进行裁决。
- 若仲裁条款无效或不可执行：实际施工人可能无法直接依据仲裁条款申请仲裁，而需要通过诉讼等其他方式解决争议。这可能导致争议解决时间延长、成本增加等不利后果。
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