在基本农田上建存放农业用品的大棚是否违法，需根据具体情况来判断，以下分情况说明：
合法情况
- 符合设施农业用地规定：如果大棚的建设符合设施农业用地的相关规定，即直接用于作物种植等农业生产活动（存放农业用品可视为辅助农业生产的行为），且未改变土地用途、未破坏耕地耕作层，同时完成了备案手续，那么这种建设行为通常是合法的。
- 特定政策允许：根据某些特定政策，在满足一定条件下，基本农田上可以建设易于恢复、不属于设施农业的蔬菜大棚，并需办理相关审批手续。若存放农业用品的大棚符合这些条件，也可能被视为合法。
违法情况
- 改变土地用途：若大棚实际用于非农业生产活动，或者虽然名义上用于农业生产但实质上改变了基本农田的用途（如将大棚改建为仓库、住宅等），则违反了《土地管理法》关于严格保护基本农田的规定，属于违法行为。
- 破坏耕地耕作层：在建设大棚时，如果采用混凝土浇筑地面、深挖地基等方式，导致土地无法再进行正常的农业种植生产，即破坏了耕地耕作层，这也将被视为违法行为。
- 未按规定备案：即使大棚的建设符合农业生产需要且未改变土地用途，但如果没有按照当地规定的程序进行备案登记，也可能面临被认定为违章建筑的风险。
法律后果与建议：
- 法律后果：若被认定为违章建筑，政府有权要求拆除大棚，并可能处以罚款。情节严重的，还可能构成刑事犯罪，如非法占用耕地罪。
- 建议：
- 了解当地政策：在建设大棚前，务必了解当地的具体规定和政策要求，明确土地性质和审批流程。
- 确保合规建设：确保大棚的建设符合设施农业用地的相关规定，不改变土地用途、不破坏耕地耕作层，并完成备案手续。
- 咨询法律意见：如有需要，可直接向我咨询，以获取准确指导，确保建设行为的合法性。
实际操作中的注意事项：
- 确认土地性质：在决定建设前，务必确认所涉土地是否为基本农田。若是，则需严格遵守相关法规；若不是（如一般农田），则通常建设大棚是被允许的，但仍需确保不影响农作物生长和土地可持续利用。
- 咨询相关部门：建议咨询当地农业、土地管理和城乡规划等部门，了解具体的法律法规要求、审批程序及建设标准。
- 避免破坏耕作层：在建设过程中，应采取措施避免破坏基本农田的耕作层，确保大棚建设不会对后续农业生产能力造成负面影响。
综上所述，基本农田上建存放农业用品的大棚是否违法，取决于大棚的建设目的、对耕地的影响以及是否完成备案手续等多个因素。因此，在进行此类建设时，务必谨慎行事，确保符合相关法律法规和政策要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。