在起诉期间互换的证据，其处理方式需根据证据的性质、来源及诉讼阶段综合判断，以下是具体分析：

1. 证据交换的合法性
   根据《民事诉讼法》第68条，当事人有权在举证期限内向法院提交证据，也可通过“证据交换”程序（法院组织）或庭前会议进行证据互换。合法交换的证据需满足以下条件：

   • 证据形式合法（如原件、公证书等）；
     
   • 证据内容与案件关联；
     
   • 未超过举证期限（除非法院准许延期）。
     若证据交换程序合法，交换后的证据可直接作为庭审依据，无需重复提交。

2. 对方提交的证据如何处理

   • 质证阶段：收到对方证据后，需在法庭指定的期限内提交书面质证意见，明确对证据真实性、合法性、关联性的认可或异议（如“三性”均不认可需说明理由）。
     
   • 反驳证据：若对方证据存在瑕疵（如伪造、逾期提交），可申请法院不予采信，或提交反驳证据（如鉴定报告、证人证言等）。
     
   • 新证据处理：若对方在庭审中突然提交新证据，可依据《民事诉讼法》第146条申请延期质证，或要求法院对逾期举证行为予以训诫、罚款。

3. 己方证据被对方质疑时的应对

   • 补强证据：若对方对己方证据真实性提出异议（如质疑签名真实性），可申请笔迹鉴定或补充证人出庭。
     
   • 证据来源说明：若证据涉及第三方（如公司账目、监控录像），需提前准备授权文件或申请法院调取，避免因证据来源不合法被排除。
     
   • 举证责任转移：若对方质疑证据关联性，可引用《民事诉讼证据规定》第53条，要求对方说明质疑理由并承担初步举证责任。

4. 特殊证据的处理规则

   • 涉密证据：若证据涉及商业秘密或个人隐私，可依据《民事诉讼法》第137条申请不公开质证，或要求法院签署保密承诺书。
     
   • 电子证据：需符合《电子签名法》及《民事诉讼证据规定》第14-16条，提供原始载体、哈希值校验等证明材料，避免因证据形式瑕疵被否定。
     
   • 逾期证据：若因客观原因（如不可抗力）逾期提交，可申请法院准许并说明理由；若因故意逾期，可能面临证据不被采纳或罚款风险。

实务建议：

• 收到对方证据后，立即核对证据清单与实际内容是否一致，避免遗漏关键信息；
  
• 对争议证据制作“质证要点表”，分项列明异议理由及法律依据；
  
• 涉及专业问题（如鉴定、审计）时，提前咨询相关领域专家，确保证据效力；
  
• 保持与法院的沟通，及时了解证据交换程序的具体要求（如是否需要公证、翻译等）。
  

如有进一步疑问（如具体证据类型处理、举证期限计算等），可直接向我咨询，我会结合案情提供针对性方案。