劳动合同约定工资包干制在符合一定条件下是合法的。以下是对这一问题的详细分析：
合法性的基础与条件
平等自愿协商：
- 包干工资制的实施必须建立在用人单位与劳动者平等、自愿协商的基础上。双方应就工资包干的具体内容、计算方式等达成一致意见，并明确写入劳动合同中。这是包干工资制具备法律效力的前提。
不违反最低工资标准：
- 包干工资总额不得低于当地政府规定的最低工资标准。这是保障劳动者基本生活的法定底线，也是判断包干工资制是否合法的重要标准。如果包干工资低于最低工资标准，那么这种约定就是违法的。
工时制度合规：
- 包干工资制下的工作时间安排需符合我国法定的工时制度。即每日工作时间不超过八小时，平均每周工作时间不超过四十四小时。对于加班情况，其计算方式和金额也需符合法律规定。如果用人单位利用包干工资制恶意安排劳动者超时加班，且不支付相应的加班工资，那么这种做法就是违法的。
明确工资构成：
- 用人单位需向劳动者清晰说明包干工资的具体构成和计算方式，包括正常工作时间工资、加班工资、奖金、津贴等各项收入。这有助于保障劳动者的知情权，确保劳动者对自己的工资组成有充分的了解。
可能存在的违法情形与风险
恶意规避加班工资：
- 如果用人单位利用包干工资制恶意规避支付加班工资的法律责任，如将正常工作时间工资和加班工资不合理地打包在一个较低的包干工资中，导致劳动者实际获得的加班报酬远低于法定标准，那么这种做法就是违法的。
侵犯知情权：
- 如果用人单位未明确告知劳动者包干工资的具体构成和计算方式，侵犯了劳动者的知情权和工资分配知情权，那么这种包干工资制也存在法律风险。劳动者有权了解自己的工资组成和计算方式，以便维护自己的合法权益。
超时加班问题：
- 即使包干工资制得到认可，用人单位也应确保劳动者每日加班不超过三小时，每月不超过三十六小时，并保障劳动者每周至少休息一天。如果用人单位违反这一规定，安排劳动者超时加班，那么可能因违反工时制度而面临法律风险。
实际操作中的建议
对于用人单位：
- 在采用包干工资制时，应确保约定内容合法合规，充分保障劳动者的合法权益。具体来说，应明确包干工资的具体构成和计算方式，确保不低于最低工资标准，并合理安排工作时间和加班工资。
对于劳动者：
- 应了解自己的权益，对于不合理的工资约定有权提出异议并寻求法律帮助。如果发现用人单位利用包干工资制恶意规避法律责任或侵犯自己的合法权益，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总结来说，劳动合同约定工资包干制在符合平等自愿协商、不违反最低工资标准、工时制度合规且明确工资构成等条件下是合法的。但用人单位和劳动者都应了解相关法律法规，确保约定内容合法合规，共同维护和谐的劳动关系。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。