劳动合同和协议合同在公司关门时的补偿是否一样，这主要取决于合同的具体内容以及公司关门的法律性质，但通常情况下，若均属于劳动合同范畴，补偿原则是一致的。以下从几个方面进行详细分析：
一、合同性质与补偿原则
劳动合同：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。当公司因各种原因（如破产、解散等）关门时，劳动者有权依据劳动合同法获得相应的经济补偿。
协议合同：这里的“协议合同”若指的是非标准劳动合同，如劳务合同、实习协议等，其补偿原则可能因合同性质而异。但如果这些协议合同在实质上构成了劳动合同关系（即符合劳动合同法的定义和特征），那么在公司关门时，劳动者同样有权获得经济补偿。若协议合同并不构成劳动合同关系，而是其他类型的民事合同，则补偿原则将依据相关民事法律进行确定，可能与劳动合同的补偿原则不同。
二、公司关门的法律性质与补偿
公司破产或解散：若公司因破产或解散而关门，根据劳动合同法的规定，劳动者有权获得经济补偿。经济补偿的标准通常按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
公司违法关闭：若公司因违法行为（如非法经营、逃税等）被关闭，劳动者同样有权获得经济补偿。此外，如果公司的违法行为给劳动者造成了损失，劳动者还可以要求公司承担赔偿责任。
三、特殊情况下的补偿
未签订书面劳动合同：如果劳动者与公司未签订书面劳动合同，但已经形成了事实上的劳动关系，那么在公司关门时，劳动者仍然有权获得经济补偿。此时，劳动者需要提供证据证明其与公司之间存在劳动关系（如工资单、工作证、考勤记录等）。
试用期内的劳动者：试用期内被解除劳动合同的劳动者，也有权获得经济补偿。补偿标准通常按照劳动者在试用期内的实际工作时间进行计算。
四、建议与注意事项
保留证据：无论签订的是劳动合同还是协议合同，劳动者都应保留好相关证据（如合同文本、工资单、工作证等），以便在公司关门时维护自己的合法权益。
及时咨询：如果公司出现关门迹象或已经关门，劳动者应及时咨询专业律师（如我），了解自己的权益和可能的补偿方案。
依法维权：如果公司拒绝支付经济补偿或存在其他违法行为，劳动者可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
总结来说，劳动合同和协议合同在公司关门时的补偿是否一样，主要取决于合同的具体内容以及公司关门的法律性质。但通常情况下，若均属于劳动合同范畴或实质上构成了劳动合同关系，补偿原则是一致的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。